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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000638`

染色体: Chr08 坐标: 4752813-4753571 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000638`
名称	SmilChr08G000638
描述	germin-like protein 9-3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4752813 - 4753571 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000214`
GeneID	`131000214`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000214`
原始查询	`SmilChr08G000638`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	germin-like protein 9-3
产物	germin-like protein 9-3
Arabidopsis	`AT3G62020` (GLP10) germin-like protein 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825375] identity=37.8; qcov=1.06; evalue=4.16e-38; confidence=medium
Rice	`Os09g0568700` (OsGLP9-3) - identity=65.1; qcov=0.922; evalue=1.93e-78; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000214

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057781986.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781986.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781986.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781986.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4752852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B133,B31
`Chr8:4752976`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B76
`Chr8:4752976`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B76
`Chr8:4753123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr8:4753304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:4753310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr8:4753337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781986.1

205 aa

102

205

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 65-196 aa PF07883 Cupin_2 89-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781986.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	65	196	1.9e-32	112.6	Cupin
`XP_057781986.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	89	156	1.3e-09	38.4	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926003.1
ATGGATTCCCACATCCCAACTCTACTCATCACCACACTACTCCTTTCCATATCTCCAAAACCAGTACTCGGAGGCGATCCCGACATCCTCACAGACTTCATCGCGCCGCCCAACTCGCCGCCGCCCAACGCCACCTTCTTCACATTCAGCGGGTTCCGGTCCCTGGTGGCGGCGCCGGTCCCGGCGAAATTCCAGGTCGTGAAGGCGACGATGGAGCAGTTCCCAGCCCTGAACGGGCAGAGCGTGTCGTACGCGGCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000214
ATGGATTCCCACATCCCAACTCTACTCATCACCACACTACTCCTTTCCATATCTCCAAAACCAGTACTCGGAGGCGATCCCGACATCCTCACAGACTTCATCGCGCCGCCCAACTCGCCGCCGCCCAACGCCACCTTCTTCACATTCAGCGGGTTCCGGTCCCTGGTGGCGGCGCCGGTCCCGGCGAAATTCCAGGTCGTGAAGGCGACGATGGAGCAGTTCCCAGCCCTGAACGGGCAGAGCGTGTCGTACGCGGCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781986.1
MDSHIPTLLITTLLLSISPKPVLGGDPDILTDFIAPPNSPPPNATFFTFSGFRSLVAAPVPAKFQVVKATMEQFPALNGQSVSYAALLYPPASANPVHTHPRAAELLFLTQGELEVGFVDSANKLYTQTLQAGDMFVFPKGLVHFQYNADAQVPAFAVSAFGSAAAGTVSLPNALFNSTVDDTVLALSFKTDVATIQKIKAGLKG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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