当前解析结果
SmilChr08G000652| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000652 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000652 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G000652 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 4847663 - 4851168 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000227 |
|---|---|
| GeneID | 131000227 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000227 |
| 原始查询 | SmilChr08G000652 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832288]; symbol=AT5G22280; hit=AT5G22280; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832288]; symbol=AT5G22280; hit=AT5G22280; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G22280 (AT5G22280)peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832288] identity=56; qcov=1.09; evalue=8.79e-34; confidence=medium |
| Rice | Os02g0536100- identity=52.8; qcov=1.08; evalue=1.89e-16; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000227 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus membrane | 核膜 | 1.00000 | XP_057782008.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057782008.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057782008.1 |
| 4 | Nucleus inner membrane | Nucleus inner membrane | 0.80000 | XP_057782008.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057782008.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:4848675 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。