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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G000652

染色体: Chr08 坐标: 4847663-4851168 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr08G000652
名称SmilChr08G000652
描述uncharacterized SmilChr08G000652
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向4847663 - 4851168 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131000227
GeneID131000227
locus_tag-
NCBI NameLOC131000227
原始查询SmilChr08G000652

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832288]; symbol=AT5G22280; hit=AT5G22280; species=arabidopsis; confidence=medium
产物peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832288]; symbol=AT5G22280; hit=AT5G22280; species=arabidopsis; confidence=medium
ArabidopsisAT5G22280 (AT5G22280)
peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832288]
identity=56; qcov=1.09; evalue=8.79e-34; confidence=medium
RiceOs02g0536100
-
identity=52.8; qcov=1.08; evalue=1.89e-16; confidence=low
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131000227

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus membrane 核膜 1.00000 XP_057782008.1
2 Endoplasmic reticulum 内质网 1.00000 XP_057782008.1
3 Endoplasmic reticulum membrane 内质网膜 1.00000 XP_057782008.1
4 Nucleus inner membrane Nucleus inner membrane 0.80000 XP_057782008.1
5 Nucleus 细胞核 0.40000 XP_057782008.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:4848675 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA
XM_057926026.1
ATTGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGGCTTGTGCTGTGCTGAAGTACGCCTAAGCCAATTTTGTTCTCCTAATCGGCTGCCATTACTGACTTCAACAAACTCAAATTTGTCCATTCATCTTCATCTTCCTTGGCTATTAACTCTTATCAGTTTGCTTTCACTCACAGTTTCCACCTTAACGCTCAAACAATCATTGAACACCATTTTCCTTCAATCAAACAATACTACAACATTTGGTAAAACCCAACTCCT...
XM_057926025.1
AATTCGTTTCCGCCATGTAGACTTTGTGGAACTTATAGCGAACTGGAACACGTAAATGGAGAATTAGTGCGTTGGATATAAAATTCGATTTGGCTAATTCGGTCCGACTCAGGAAAGAAATAAACAATCTTTGAAACCCTTCATTTTTTACTTTGTGTGTATGGATATCGAGCTCCAAAATTAAGCGGAATCGGGCATTATTCTTAACTATTACTACTTTCTTTTGAACATTATAAGTGTTTAAGTTGAATAAGTAAGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
LOC131000227
ATGTCGAGACCAATGCTGCTTGTCTTTCTGTTGCTGATACTGATTATTACATCCCAATTTGAATGGAGACAGCAAATAGTAAATGACATGGACACAAATACGGCGGTGTCTCAGAAGCAACAACAGATCTCGAAAAGGGAGGAAGGTGTCAAAGAAAAGATCATCTTGTCACAGGAAAAGAGCATCCAGAAACTGAATGAGGTTGTTAAGAATCTTAGGGAACAGCTACAGCAATGTCGGAGCAGTAATGCCACTTTCAC...
LOC131000227
ATGTCGAGACCAATGCTGCTTGTCTTTCTGTTGCTGATACTGATTATTACATCCCAATTTGAATGGAGACAGCAAATAGTAAATGACATGGACACAAATACGGCGGTGTCTCAGAAGCAACAACAGATCTCGAAAAGGGAGGAAGGTGTCAAAGAAAAGATCATCTTGTCACAGGAAAAGAGCATCCAGAAACTGAATGAGGTTGTTAAGAATCTTAGGGAACAGCTACAGCAATGTCGGAGCAGTAATGCCACTTTCAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057782008.1
MSRPMLLVFLLLILIITSQFEWRQQIVNDMDTNTAVSQKQQQISKREEGVKEKIILSQEKSIQKLNEVVKNLREQLQQCRSSNATFTSLSETERQLILDD
XP_057782009.1
MSRPMLLVFLLLILIITSQFEWRQQIVNDMDTNTAVSQKQQQISKREEGVKEKIILSQEKSIQKLNEVVKNLREQLQQCRSSNATFTSLSETERQLILDD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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