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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000659`

染色体: Chr08 坐标: 4892942-4893588 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000659`
名称	SmilChr08G000659
描述	transcription repressor OFP6-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4892942 - 4893588 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000235`
GeneID	`131000235`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000235`
原始查询	`SmilChr08G000659`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription repressor OFP6-like
产物	transcription repressor OFP6-like
Arabidopsis	`AT2G36026` (AT2G36026) Ovate family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241209] identity=66.1; qcov=0.536; evalue=1.02e-23; confidence=medium
Rice	`Os02g0679700` (OsOFP6) - identity=51.2; qcov=0.727; evalue=6.11e-22; confidence=medium
GO	GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04844 (Ovate)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000235

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057782014.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782014.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057782014.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782014.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782014.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4893086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:4893127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C71
`Chr8:4893136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B134,B31,B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782014.1

110 aa

110

Ovate

PF04844 Ovate 44-98 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782014.1`	Pfam	`PF04844`	Ovate	Family	44	98	8.6e-26	90.5	Transcriptional repressor, ovate

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926031.1
ATTTGCAATTAACCCAAAAATTAATGATTTATGCTTCTGTCATAGTCCAACCATACCTTTAAAGACACTCGCCTATTTGGAAATCTTTAAATATTTTTAATATATATAACCCATTAAATCCCTACACATTTATCAAAGCATCCATGCAAGTAATTTGAATCGCGATATCACCAGCGCACATGCCTTCCACCAATAATAGATGGAAACTGAAGAATCTGTTGATATCTAGCTGTGCATCTCGGCAACCGAGAAGCGCCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000235
ATGCCTTCCACCAATAATAGATGGAAACTGAAGAATCTGTTGATATCTAGCTGTGCATCTCGGCAACCGAGAAGCGCCACCACTCCGCAGATGATCAACGACAGTTTCGCCGTCGCCGTGGTCAAGGAATCCGACGATCCGTATCGCGATTTCCGGCAATCGATGCTTGAAATGATCTCCGAGAAAGAGATATATTCGAGGAGCGATCTTCAGCAGCTCCTCCGCTGCTTTCTCGACCTAAATCCGCCCCGCCACCATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782014.1
MPSTNNRWKLKNLLISSCASRQPRSATTPQMINDSFAVAVVKESDDPYRDFRQSMLEMISEKEIYSRSDLQQLLRCFLDLNPPRHHEIIVRAFIDIWNAAEDRTPPPSFK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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