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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000669`

染色体: Chr08 坐标: 4960000-4963770 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000669`
名称	SmilChr08G000669
描述	receptor protein kinase TMK1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4960000 - 4963770 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000245`
GeneID	`131000245`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000245`
原始查询	`SmilChr08G000669`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor protein kinase TMK1-like
产物	receptor protein kinase TMK1-like
Arabidopsis	`AT2G01820` (AT2G01820) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814713] identity=44.7; qcov=0.977; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os04g0685900` (OsRLCK174) - identity=49.7; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000245

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057782028.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782028.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782028.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782028.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782028.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4960309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:4960368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:4960865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:4960973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B73,C12,C75
`Chr8:4961081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:4961147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr8:4961503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:4961762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C83
`Chr8:4962054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:4962088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr8:4962244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:4962333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782028.1

961 aa

480

961

LRRNT_2

LRR_1

LRRNT_2

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 30-70 aa PF00560 LRR_1 196-216 aa PF00560 LRR_1 269-291 aa PF08263 LRRNT_2 333-371 aa PF00069 Pkinase 621-893 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 622-894 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782028.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	30	70	8.7e-08	33.0	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057782028.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	196	216	1.4e-12	45.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057782028.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	269	291	1.4e-12	45.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057782028.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	333	371	8.7e-08	33.0	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057782028.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	621	893	8.6e-46	157.2	Protein kinase domain
`XP_057782028.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	622	894	9.6e-45	153.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926045.1
CAAAGAAGCAGAATAAGAAATTTTGTTCGGTTTCTTGAAATCCAGCTAATATTGAAACAAAATATTACTCCAAAATATCCGAAATAAAGAAAGAGATTTTTGTGGTGTGAAAAAGTTAAAAATATTTGGTAGACAGCATTACAGTTGAGAGAGAGAGACTTGTTGTAGCTTTGATCATCTCGCTTGCACTTAATGATCTACGCCTGTCGGTAAAAAGATAGCTATATCACAAAATATAGCAACATGCAATTCAATAATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000245
ATGGAATTCAGCTCTACAAACTGCAAAATGCGCATTCTTGCTGGGTTTCTTGCTTGCATTTTGGTAAGGGTTCACACCTTCACCGACGAGAATGATTTCAAGATTCTGAATGATTTCGTGGATGGGCTGAGTAATCCGGAGCTCTTGAAATGGCCCGAAAATGGCGATGATCCATGTGGGCCCCCTGCATGGCCTCATCTGGTCTGCTCCAATGGCAGAGTCACTCAGATTCAGGTACAAAATCTTGGATTAGAGGGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782028.1
MEFSSTNCKMRILAGFLACILVRVHTFTDENDFKILNDFVDGLSNPELLKWPENGDDPCGPPAWPHLVCSNGRVTQIQVQNLGLEGPLPPNLNQLEKLENVGLQRNRFNGDLPSFSGLSNLQFAYLDFNEFETIPLDFFNGLSSIRVLALDDNPFNKSSGWIIPSELAECSQLVNFSCSSCNIVGPLPDFFGKFPSLDSLRLSYNRLSGAIPSTFSDSMLQVLWLNDQDGDGMTGPIDVIATLLGLTVAWLHGNHFSGPI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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