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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000671`

染色体: Chr08 坐标: 4971863-4974609 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000671`
名称	SmilChr08G000671
描述	aluminum-activated malate transporter 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	4971863 - 4974609 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000248`
GeneID	`131000248`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000248`
原始查询	`SmilChr08G000671`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aluminum-activated malate transporter 2-like
产物	aluminum-activated malate transporter 2-like
Arabidopsis	`AT1G08440` (AT1G08440) aluminum activated malate transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837364] identity=46.6; qcov=0.908; evalue=9.52e-134; confidence=high
Rice	`Os04g0417000` (OsALMT1) - identity=41.4; qcov=0.949; evalue=4.89e-100; confidence=medium
GO	GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0015743 (malate transport)
KEGG	-
Pfam	PF11744 (ALMT); PF13515 (FUSC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000248

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057782035.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782035.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782035.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782035.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782035.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:4972099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr8:4972137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr8:4972143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr8:4972158`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B134,B31,B36,B89,C53,C65
`Chr8:4972350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr8:4972503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr8:4972611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B19,B65,C10,C24
`Chr8:4973775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr8:4973822`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B79
`Chr8:4973822`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B79
`Chr8:4973830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr8:4974395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782035.1

435 aa

218

435

ALMT

FUSC_2

PF11744 ALMT 22-362 aa PF13515 FUSC_2 64-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782035.1`	Pfam	`PF11744`	ALMT	Family	22	362	1.1e-119	401.1	Aluminium activated malate transporter
`XP_057782035.1`	Pfam	`PF13515`	FUSC_2	Family	64	189	3.8e-09	37.5	Fusaric acid resistance protein-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926052.1
ATGTAAGTGGCAATTAACTAGTGCCAAAGGCTCCACAAAACACTATATTTGATATTTATATAAATCCCACATTTCCCATGTTAAAGAAACACAGCTCAAGCTAGAGGCAAAAATGGCGTTAGAGAATGTGAAGCATCGGGCAAAAATGGTGATGAATATGGCGACTGAAAGCAAGAAAATCGGAGCTGAAGATCCTAGAAAAATTCTCCACTCACTCAAAGTGGGATTAGCCATGGCGGCAGTCTCTTTAATCTACTACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000248
ATGGCGTTAGAGAATGTGAAGCATCGGGCAAAAATGGTGATGAATATGGCGACTGAAAGCAAGAAAATCGGAGCTGAAGATCCTAGAAAAATTCTCCACTCACTCAAAGTGGGATTAGCCATGGCGGCAGTCTCTTTAATCTACTACTTCGATCTCTTTCGCGACGGCTATTCCACCGGCAGTGGCCTTTACGCCATGTGGGCCGTCAACACCGTCGCCGTCGTCTTCGAGTTCTCCATAGGAGCGACGATTGGCAAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782035.1
MALENVKHRAKMVMNMATESKKIGAEDPRKILHSLKVGLAMAAVSLIYYFDLFRDGYSTGSGLYAMWAVNTVAVVFEFSIGATIGKGVNRTLATVVGGALGVGAHGATSFAGNTAESIMLAFIIFFICGVATFGRFIPKLKARNDYFFLIVIVTYGLIAVSTFRGEKLIEMAEKRLSTVLVGYATVLVCCCICPCWAGQDLHTLVATNIDTLGTFLADFGDEYFETANSNDKSHEIRASMEGYRAVINSKSVEESLVNFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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