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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000683`

染色体: Chr08 坐标: 5077603-5080633 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000683`
名称	SmilChr08G000683
描述	glycosyltransferase BC10-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5077603 - 5080633 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000259`
GeneID	`131000259`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000259`
原始查询	`SmilChr08G000683`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosyltransferase BC10-like
产物	glycosyltransferase BC10-like
Arabidopsis	`AT3G52060` (AT3G52060) core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824369] identity=61.2; qcov=0.789; evalue=6.13e-136; confidence=high
Rice	`Os03g0648100` - identity=58; qcov=0.863; evalue=1.86e-129; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02485 (Branch)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000259

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057782050.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782050.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782050.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782050.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782050.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5077827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B31,C55,C64,C65
`Chr8:5077833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B5,B98
`Chr8:5077874`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B31,B69,C54
`Chr8:5077874`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B31,B69,C54
`Chr8:5077884`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A9
`Chr8:5077884`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A9
`Chr8:5077887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr8:5077908`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B134,B31,C55,C64,C65,C66
`Chr8:5077958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr8:5077979`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A13,B123,B72,C4
`Chr8:5077979`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A13,B123,B72,C4
`Chr8:5077980`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A16,A21,B3,B36,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782050.1

408 aa

204

408

Branch

PF02485 Branch 133-374 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782050.1`	Pfam	`PF02485`	Branch	Family	133	374	9.2e-58	196.4	Core-2/I-Branching enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926067.1
ACACATTGTTAAAGTACAATCTTATTCTTCTAAATACTCATGCACAAACTAAATAGGCTATGAATAGCTGAACAAAGGGAGTATTATAATTACGAATGGCTAGTTTTTATTTTCACTATTTGAAAATGACTATTTTAATAACCCTATATAAAATATCGCTAAATTGATTATAATTCAGAAATTACCCATTTTTTTTTTTAAAAAAAGAGAAAAAATGGGAAAGAGAAAAACGTGTAGGCCATTGACGGCGTTAAGTCCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000259
ATGGGAAAGAGAAAAACGTGTAGGCCATTGACGGCGTTAAGTCCAGCGTCATCATCTTCCCATCATATCCCCTCTACTGTGAAACTTCCCTCTTCACTTCTTCACTTCCTTTCACTACTGCCATTGCATCAACTCCACCACCACCTCCCCCAAAACCCTACATTCCCCCCAATGGGCGCCCCCTCCGCCGTGGCCCCCGCTCTCACCCTCCTCCTCTCCCTCCCCCTCCTCTACTTCTTCCTCCTCACCCCCCGCCAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782050.1
MGKRKTCRPLTALSPASSSSHHIPSTVKLPSSLLHFLSLLPLHQLHHHLPQNPTFPPMGAPSAVAPALTLLLSLPLLYFFLLTPRQFPIPLSDELDDLSLFHKAIAMDSSRRSPHHLPAAKSHLSAPLRPPKIAFLFLTNSALHFAPLWERFFSTAHPHRFNIYIHADPFASLPPLRGVFRGRLIPAKRTHRSSATLISAARRLLATAMLDDPANAYFALISQHCIPLRSFNYLHTFLFDLSRLSPDLEFPSYIEILDNE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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