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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000691`

染色体: Chr08 坐标: 5138959-5140871 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G000691`
名称	SmilChr08G000691
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5138959 - 5140871 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000268`
GeneID	`131000268`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC131000268`
原始查询	`SmilChr08G000691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like
产物	E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like
拟南芥	`AT5G22000` (RHF2A) RING-H2 group F2A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832260] identity=53.51; qcov=0.602; evalue=5.22e-28; confidence=medium
水稻	`Os11g0572500` (OsRFP) - identity=61.8; qcov=0.478; evalue=1.29e-30; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000268

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质	0.80000	`XP_057782063.1`
2	自噬囊泡	0.40000	`XP_057782063.1`
3	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057782063.1`
4	自噬体	0.20000	`XP_057782063.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5139988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:5140189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B19,B2,B26,B46
`Chr8:5140195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B117
`Chr8:5140813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926081.1
AGCCCCCCACCTGAAGTTATTTCCGCTGGCTCTAATTCTCCAATTATGACTGTTGGAGGAGATTCTGCACATCTTATTACACGGTCTTCTACAGCTCAAGCTGAACAGCTTGTGACTACAGCCTCAGGATCGAGTCCTGGAGCATATCAACATGGAACATCTTCAAGCAATAGATCTCCTGCCCACACCTCCCCCAATAGTCAAGATAGAGCTGGACCTTCAGATTTCCAGACATTTTCAGATTCTCTGAAATCCCGGCT...

XM_057926080.1
AGCCCCCCACCTGAAGTTATTTCCGCTGGCTCTAATTCTCCAATTATGACTGTTGGAGGAGATTCTGCACATCTTATTACACGGTCTTCTACAGCTCAAGCTGAACAGCTTGTGACTACAGCCTCAGGATCGAGTCCTGGAGCATATCAACATGGAACATCTTCAAGCAATAGATCTCCTGCCCACACCTCCCCCAATAGTCAAGATAGAGCTGGACCTTCAGATTTCCAGACATTTTCAGATTCTCTGAAATCCCGGCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057782063.1_41053
ATGACTGTTGGAGGAGATTCTGCACATCTTATTACACGGTCTTCTACAGCTCAAGCTGAACAGCTTGTGACTACAGCCTCAGGATCGAGTCCTGGAGCATATCAACATGGAACATCTTCAAGCAATAGATCTCCTGCCCACACCTCCCCCAATAGTCAAGATAGAGCTGGACCTTCAGATTTCCAGACATTTTCAGATTCTCTGAAATCCCGGCTTAGTGCTTTTTCAACAAGATACAAAGAGTCCATAACAAAGAGCAC...

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057782064.1_41054
ATGACTGTTGGAGGAGATTCTGCACATCTTATTACACGGTCTTCTACAGCTCAAGCTGAACAGCTTGTGACTACAGCCTCAGGATCGAGTCCTGGAGCATATCAACATGGAACATCTTCAAGCAATAGATCTCCTGCCCACACCTCCCCCAATAGTCAAGATAGAGCTGGACCTTCAGATTTCCAGACATTTTCAGATTCTCTGAAATCCCGGCTTAGTGCTTTTTCAACAAGATACAAAGAGTCCATAACAAAGAGCAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782063.1
MTVGGDSAHLITRSSTAQAEQLVTTASGSSPGAYQHGTSSSNRSPAHTSPNSQDRAGPSDFQTFSDSLKSRLSAFSTRYKESITKSTRGWKERLFARNSSTPEPNSEVREADQRNANGPGIATISRMMDHLQIAEHDRTNTSTTSRTVEDTRSPDPSARQVFVMGSNLSLNEDETQAPTTASPAST

XP_057782064.1
MTVGGDSAHLITRSSTAQAEQLVTTASGSSPGAYQHGTSSSNRSPAHTSPNSQDRAGPSDFQTFSDSLKSRLSAFSTRYKESITKSTRGWKERLFARNSSTPEPNSEVREADQRNANGPGIATISRMMDHLQIAEHDRTNTSTTSRTVEDTRSPDPSARQVFVMGSNLSLNEDETQAPTTASPAST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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