当前解析结果
SmilChr08G000692| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000692 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000692 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G000692 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 5155912 - 5157477 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131000270 |
|---|---|
| GeneID | 131000270 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000270 |
| 原始查询 | SmilChr08G000692 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000270 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057782067.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057782069.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782067.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057782067.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057782067.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:5156401 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A9 |
Chr8:5156403 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,B19,B26,B85 |
Chr8:5156525 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,B46 |
Chr8:5156554 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,B4,B48,C82 |
Chr8:5156623 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 63 | A13,A20,A22,A5,B100,B105,B107,B109,B112,B113,B120,B124,B127,B128,B131,B135,B137,B14,B19,B2,B27,B32,B34,B35,B36,B37,B42,B43,B44,B48,B49,B58,B63,B66,B79,B8,B82,B88,B9,B90,B92,C21,C24,C29,C31,C34,C39,C41,C46,C5,C52,C56,C57,C60,C61,C72,C74,C77,C86,D1,D2,D4,D7 |
Chr8:5156629 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 128 | A11,A13,A15,A16,A18,A20,A23,A25,A4,A7,B10,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B118,B120,B121,B122,B123,B125,B127,B13,B130,B133,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B18,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B38,B39,B4,B42,B43,B44,B47,B5,B50,B54,B55,B57,B59,B60,B61,B65,B66,B68,B70,B71,B73,B75,B77,B81,B83,B84,B91,B95,B99,C1,C10,C11,C12,C14,C18,C20,C21,C24,C25,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C4,C42,C43,C44,C45,C48,C49,C50,C53,C54,C55,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C79,C8,C83,C84,C9,D1,D10,D2,D5,D6,D9 |
Chr8:5156680 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 28 | A2,A9,B113,B119,B12,B2,B22,B28,B37,B40,B46,B47,B5,B53,B63,B68,B76,B9,B91,C17,C22,C28,C47,C59,C6,C77,C83,C86 |
Chr8:5156689 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr8:5156747 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B136,B45 |
Chr8:5156818 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B13,B38,B61 |
Chr8:5157390 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C13 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。