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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000704`

染色体: Chr08 坐标: 5236393-5238999 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000704`
名称	SmilChr08G000704
描述	probable diphthine methyl ester synthase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5236393 - 5238999 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000292`
GeneID	`131000292`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000292`
原始查询	`SmilChr08G000704`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable diphthine methyl ester synthase
产物	probable diphthine methyl ester synthase
Arabidopsis	`AT4G31790` (AT4G31790) Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829307] identity=79.4; qcov=0.989; evalue=4.54e-165; confidence=high
Rice	`Os03g0355800` - identity=73.7; qcov=0.996; evalue=2.91e-159; confidence=high
GO	GO:0004164 (diphthine synthase activity); GO:0017183 (protein histidyl modification to diphthamide)
KEGG	-
Pfam	PF00590 (TP_methylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000292

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782111.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782111.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782111.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782111.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782111.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5236609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,C14,C50,C68
`Chr8:5236625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A3,B64,C27
`Chr8:5237126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D4
`Chr8:5237175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B101,B56,B96
`Chr8:5237519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,B9,C38
`Chr8:5237520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr8:5237914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782111.1

275 aa

138

275

TP_methylase

PF00590 TP_methylase 1-241 aa

XP_057782112.1

275 aa

138

275

TP_methylase

PF00590 TP_methylase 1-241 aa

XP_057782113.1

275 aa

138

275

TP_methylase

PF00590 TP_methylase 1-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782111.1`	Pfam	`PF00590`	TP_methylase	Domain	1	241	6.8e-24	85.7	Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases
`XP_057782112.1`	Pfam	`PF00590`	TP_methylase	Domain	1	241	6.8e-24	85.7	Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases
`XP_057782113.1`	Pfam	`PF00590`	TP_methylase	Domain	1	241	6.8e-24	85.7	Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926128.1
TTACATACTGGCAGCGCCGCTTCTTTCTTCTCTCTCTTCTCACTCTCGTCTCCTCTCTCTCTCTCTTGCATTCTTGGCAGCGCCGCTTTCTGTCTCTCTCACTCACTCTCTCTCTCGTCTCCGGCCTCTCCGTGCCGCCGCCCTCGCCGGCTTGCTCAACCCTCTCGTCTTCCAGTTTCTCTCATTTCCTCTTTCAGTGCGCCGCCGCGCTCCCAGACTCTCCCAGTCTTCCTCGTCGCCCCGCCTCCTCCGTCCTTGAC...

XM_057926129.1
TTACATACTGGCAGCGCCGCTTCTTTCTTCTCTCTCTTCTCACTCTCGTCTCCTCTCTCTCTCTCTTGCATTCTTGGCAGCGCCGCTTTCTGTCTCTCTCACTCACTCTCTCTCTCGTCTCCGGCCTCTCCGTGCCGCCGCCCTCGCCGGCTTGCTCAACCCTCTCGTCTTCCAGTTTCTCTCATTTCCTCTTTCAGTGCGCCGCCGCGCTCCCAGACTCTCCCAGTCTTCCTCGTCGCCCCGCCTCCTCCGTCCTTGAC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131000292
ATGTTATACATAATTGGATTAGGGTTAGGAGATGAGAAAGACATCACACTAAGAGGGCTCGAGGCAATCAAGAAATGCAGTAAAGTTTATATGGAGGCCTACACTTCTCTCCTCTCCTTCGGCATCACCTCCGATGGCCTCTCGAAATTGGAAAAGGTTTATGGGAGACCTATAATTGTCTCAGACAGGGAAATGGTTGAGGAGAAGGCAGATGACATGCTGTTAGAAGCTCAGGTTTCTGACGTGGCATTTCTGGTCGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057782111.1
MLYIIGLGLGDEKDITLRGLEAIKKCSKVYMEAYTSLLSFGITSDGLSKLEKVYGRPIIVSDREMVEEKADDMLLEAQVSDVAFLVVGDPFGATTHSDLVVRAKKLGVDIKVVHNASVMNAIGVCGLQLYRYGETISIPFFTETWKPDSFYDKIKRNRELGLHTLCLLDIKVKEPSLESLCRGKKVYEPPRFMTINTAIEQLLEVVQNHHDSAYNEDTTCVGLARVGCEDQMIVAGSMKQLLTIDFGPPLHCLVIVGDTH...

XP_057782112.1
MLYIIGLGLGDEKDITLRGLEAIKKCSKVYMEAYTSLLSFGITSDGLSKLEKVYGRPIIVSDREMVEEKADDMLLEAQVSDVAFLVVGDPFGATTHSDLVVRAKKLGVDIKVVHNASVMNAIGVCGLQLYRYGETISIPFFTETWKPDSFYDKIKRNRELGLHTLCLLDIKVKEPSLESLCRGKKVYEPPRFMTINTAIEQLLEVVQNHHDSAYNEDTTCVGLARVGCEDQMIVAGSMKQLLTIDFGPPLHCLVIVGDTH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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