当前解析结果
SmilChr08G000710| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000710 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000710 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G000710 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 5271259 - 5274246 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131000285 |
|---|---|
| GeneID | 131000285 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000285 |
| 原始查询 | SmilChr08G000710 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os07g0190600; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os07g0190600; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | AT2G05642 (AT2G05642)Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430] identity=21.9; qcov=0.662; evalue=8.57e-16; confidence=weak |
| Rice | Os07g0190600- identity=24.7; qcov=0.594; evalue=1.27e-20; confidence=weak |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006260 (DNA replication); GO:0006281 (DNA repair); GO:0006310 (DNA recombination) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF08646 (Rep_fac-A_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000285 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057782098.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057782098.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057782098.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057782098.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057782098.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057782098.1PF08646
Rep_fac-A_C 243-352 aa
XP_057782099.1PF08646
Rep_fac-A_C 235-344 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057782098.1 |
Pfam | PF08646 |
Rep_fac-A_C | Domain | 243 | 352 | 8e-11 | 42.6 | Replication factor-A C terminal domain |
XP_057782099.1 |
Pfam | PF08646 |
Rep_fac-A_C | Domain | 235 | 344 | 7.8e-11 | 42.7 | Replication factor-A C terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。