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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000730`

染色体: Chr08 坐标: 5415616-5418616 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000730`
名称	SmilChr08G000730
描述	uncharacterized SmilChr08G000730
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5415616 - 5418616 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000307`
GeneID	`131000307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000307`
原始查询	`SmilChr08G000730`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	isopentenyl-diphosphate delta-isomerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835655]; symbol=AT5G55610; hit=AT5G55610; species=arabidopsis; confidence=high
产物	isopentenyl-diphosphate delta-isomerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835655]; symbol=AT5G55610; hit=AT5G55610; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G55610` (AT5G55610) isopentenyl-diphosphate delta-isomerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835655] identity=50.5; qcov=0.847; evalue=6.85e-90; confidence=high
Rice	`Os12g0498800` - identity=52.5; qcov=0.858; evalue=1.2e-76; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057782134.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057782134.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057782134.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782134.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782134.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5416060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:5416096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B115
`Chr8:5416105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:5417131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B75,C2
`Chr8:5417174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B69,C10,C75
`Chr8:5417308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr8:5417689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr8:5418020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C15
`Chr8:5418049`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	A10,A13,A3,A5,A7,B103,B108,B117,B127,B133,B3,B38,B39,B40,B63,B80,B91,B97,C26,C38,C45,C48,C49,C76,C79,D2
`Chr8:5418050`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A10,A13,A3,A5,A7,B103,B108,B117,B127,B133,B3,B38,B39,B40,B63,B80,B91,B97,C26,C38,C45,C48,C49,C76,C79,D2
`Chr8:5418193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:5418356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926151.1
AGAGACAATGGTTTATCTAATTACAAGCCGACAAAACCCAATGCCGCTAGGGTTTGGGAGAACAACAATTTGATAATCCGACACCCTTTCTCCTCCCAACCAGAACTTCATCTTCTCTGCTTATTCACCACGAATCATCTCTACTTCTCGATCTTCTTGCGAATCTTCGCCAGCTGTATTGGGGAAAAGCGTATTCCTCTGTTTTTGGCTGTTGGGTTTAAAATCTTCACCTGTTAAGGGTTTGTAAGCAAAGAATCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000307
ATGGCGACCAGGGCAATACTCGATGCGCTGCTGAAAAAACCCAGCTTTGGGAACCAAGCGTTTAGCTCCAGAGACCCATTCTTCGGCAGCTTTGTGGGCGCTTCCTCCTCCGCTGCCGCCGCCGCTTCTTTTGCCATTGCTACTCCTTTTGCATATCGAGCTTTGTTTGGTAATGACCCTATGCAATATGCATATTGTGATGCTGGTGCAATCTTGGGTGAAGATCTCAATGCTGCTATTCGAGCGGGGCAAGTTGGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782134.1
MATRAILDALLKKPSFGNQAFSSRDPFFGSFVGASSSAAAAASFAIATPFAYRALFGNDPMQYAYCDAGAILGEDLNAAIRAGQVGSGYVDAAIGENNTKSYWTGNVFGNDELSRSFKQYDIKLKPLFSAFHWKNFGLTSLRSFLLFYLPLLEPRRPTEDDDEDFLVENPEEHRVDLVEPFKKSVIQIIRETSVVTTRRILERLAVHYASQRIAWKLLKDVPKSAIRKAGRKMPTCTFCYCVSRTTFRGHLLGVVASWAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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