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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000732`

染色体: Chr08 坐标: 5422072-5426986 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000732`
名称	SmilChr08G000732
描述	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5422072 - 5426986 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000308`
GeneID	`131000308`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000308`
原始查询	`SmilChr08G000732`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1-like
产物	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1-like
Arabidopsis	`AT2G27090` (AT2G27090) bZIP transcription factor (DUF630 and DUF632) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817251] identity=49; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0686500` - identity=32.1; qcov=1.04; evalue=2.01e-111; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04782 (DUF632); PF04783 (DUF630)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000308

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057782135.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057782135.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782135.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782135.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782135.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5422312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B18,B65
`Chr8:5422428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr8:5422775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B117,B5,B97,C77
`Chr8:5425007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:5425324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C49
`Chr8:5425326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:5425401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr8:5425620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B35,B88,C61
`Chr8:5425775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:5426004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B88,C12,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782135.1

734 aa

367

734

DUF630

DUF632

PF04783 DUF630 1-58 aa PF04782 DUF632 309-649 aa

XP_057782137.1

734 aa

367

734

DUF630

DUF632

PF04783 DUF630 1-58 aa PF04782 DUF632 309-649 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782135.1`	Pfam	`PF04783`	DUF630	Family	1	58	8.4e-22	77.8	Protein of unknown function (DUF630)
`XP_057782135.1`	Pfam	`PF04782`	DUF632	Family	309	649	6.4e-102	341.8	Protein of unknown function (DUF632)
`XP_057782137.1`	Pfam	`PF04783`	DUF630	Family	1	58	8.4e-22	77.8	Protein of unknown function (DUF630)
`XP_057782137.1`	Pfam	`PF04782`	DUF632	Family	309	649	6.4e-102	341.8	Protein of unknown function (DUF632)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926152.1
TATTTTTTCACACCCTAAAAAGTGATTTACAGTAGAATTTCCATTTCTTCTGTTATGTTAATGTCAGATGCAGCGAAGGAGAGGACCCCGCCTCCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTGTGCCTGCCACAATGGGATTTCCATTTCACTGCAATTTGCATGCAAGCTTTGTTGCAACCCCGATTTGCCTTTTTCCTACGTGACAGGCTTGCTGCCATACACGCACTCACACACACAATCTCTCTCTC...

XM_057926154.1
GTTAATGTCAGATGCAGCGAAGGAGAGGACCCCGCCTCCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTGTGCCTGCCACAATGGGATTTCCATTTCACTGCAATTTGCATGCAAGCTTTGTTGCAACCCCGATTTGCCTTTTTCCTACGTGACAGGCTTGCTGCCATACACGCACTCACACACACAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCCTTTTTGTGCCTATACGTGTGCGAAGATTCCCTCTATCGTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000308
ATGGGAGTCTCGAATTCCCGGTTGGAAGAAGACAAGAGCCTGCAGCTCTGCCGCGCTAGGAAGAAATTCATCAAACAAGCACTTAATGGCAGGTGTTCCCTTGCAGCAGCTCACACTGCTTATATTGAGGAATTGAAAATCATAGGAGCTGCTTTGAGAAGATTTGTGGAACCTGATCAGCTTCAGCTTGAATTTTTAGCCTATCCTGCAACAAGTGCTACTCCTCAGCCACTTGCTTTGACTGAGAAGCCTGTCACTCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782135.1
MGVSNSRLEEDKSLQLCRARKKFIKQALNGRCSLAAAHTAYIEELKIIGAALRRFVEPDQLQLEFLAYPATSATPQPLALTEKPVTRLSLASPSQSQHVDAQLPSPSQYQAHPMKFTGTVSRKIEEKPPVPVVVSVDSTTTPPGAVSSFETPSDNPPWDYFGLFHHVDNEYSAVDQGSEFSDEIRHLGEEEGIPDLEDVRVSSSSEETHESEEEFDEPPIASLVRSFKNVNAAAEGVGNGESESAISTESETKHNVNERN...

XP_057782137.1
MGVSNSRLEEDKSLQLCRARKKFIKQALNGRCSLAAAHTAYIEELKIIGAALRRFVEPDQLQLEFLAYPATSATPQPLALTEKPVTRLSLASPSQSQHVDAQLPSPSQYQAHPMKFTGTVSRKIEEKPPVPVVVSVDSTTTPPGAVSSFETPSDNPPWDYFGLFHHVDNEYSAVDQGSEFSDEIRHLGEEEGIPDLEDVRVSSSSEETHESEEEFDEPPIASLVRSFKNVNAAAEGVGNGESESAISTESETKHNVNERN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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