当前解析结果
SmilChr08G000733| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000733 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000733 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G000733 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 5434141 - 5437195 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131000311 |
|---|---|
| GeneID | 131000311 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000311 |
| 原始查询 | SmilChr08G000733 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Fe(3+) dicitrate transport system permease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832231]; symbol=AT5G21070; hit=AT5G21070; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | Fe(3+) dicitrate transport system permease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832231]; symbol=AT5G21070; hit=AT5G21070; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G21070 (AT5G21070)Fe(3+) dicitrate transport system permease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832231] identity=90.6; qcov=0.982; evalue=4.99e-143; confidence=high |
| Rice | Os01g0277700- identity=84.3; qcov=0.982; evalue=2.91e-134; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000311 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057782139.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057782139.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057782139.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057782139.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782139.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:5434688 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B79,C15 |
Chr8:5435468 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B136 |
Chr8:5435549 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B139,C24,C61,C68 |
Chr8:5435750 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B105 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。