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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000738`

染色体: Chr08 坐标: 5469348-5471604 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000738`
名称	SmilChr08G000738
描述	zeaxanthin epoxidase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5469348 - 5471604 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000318`
GeneID	`131000318`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000318`
原始查询	`SmilChr08G000738`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zeaxanthin epoxidase, chloroplastic
产物	zeaxanthin epoxidase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G21530` (AT2G21530) SMAD/FHA domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816692] identity=50.9; qcov=0.816; evalue=1.26e-51; confidence=high
Rice	`Os11g0127800` - identity=57; qcov=0.618; evalue=8.89e-48; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00498 (FHA); PF16697 (Yop-YscD_cpl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000318

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057782154.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057782154.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782154.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782154.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782154.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5469651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B136,B14,B88,C8
`Chr8:5470777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B57,B67,C15,C7
`Chr8:5470823`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A14,A9,B18,B21,B29,B3,B41,B43,B44,B5,B6,B62,B65,B75,B83,B86,B93,C19,C51,C6,C66,D5
`Chr8:5471348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,C65,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782154.1

207 aa

104

207

Yop-YscD_cpl

FHA

PF16697 Yop-YscD_cpl 95-176 aa PF00498 FHA 103-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782154.1`	Pfam	`PF16697`	Yop-YscD_cpl	Domain	95	176	8.6e-09	36.4	Inner membrane component of T3SS, cytoplasmic domain
`XP_057782154.1`	Pfam	`PF00498`	FHA	Family	103	170	1.3e-15	58.2	FHA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926171.1
TAATTGTATGCCACGTACTCTCATTCACCTCTCTTTTTCTATCTATTTATTGATTAGTTAGAACTGTTACATATTCATTTCATAAAAATCTTGATTAAATTGTTGAGCCTCAAAAACAGGAATTGAGATCAGAAATGGAGATGAGTCTCTCGTATGCCAACCCCAATTCTCTCTCCCCAACATTTTTCGCAGCCAAAACTACCTCTTTTGGCAGTAGCGCTGTTAATTTCCATGGCTACAATTGCCTTCCTAGAAAGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000318
ATGGAGATGAGTCTCTCGTATGCCAACCCCAATTCTCTCTCCCCAACATTTTTCGCAGCCAAAACTACCTCTTTTGGCAGTAGCGCTGTTAATTTCCATGGCTACAATTGCCTTCCTAGAAAGCTCAAATTTAGTGCGCGAGAGTTGAGGAAGTTTGTCGCCATAAGGGCTTCCGATTCTGCAACCACCGCTGCCACCAATGCTTCTGCTGCAACGTGGCTTCTCGAACCCGTAGGTGATGGTGATTTTGGGCATATAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782154.1
MEMSLSYANPNSLSPTFFAAKTTSFGSSAVNFHGYNCLPRKLKFSARELRKFVAIRASDSATTAATNASAATWLLEPVGDGDFGHIGYKIARPGAFEIDSNVVTVGRVPEKADIVIPVPTVSGLHARIQKTEEKLLITDLDSTNGTFINEKRLLPGVVSPASAGNLITFGDTNLAIFKIYRVEKEELSSEGEAEKVANTNLKSTTSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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