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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000752`

染色体: Chr08 坐标: 5547204-5550878 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000752`
名称	SmilChr08G000752
描述	polycomb group protein FIE1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5547204 - 5550878 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000331`
GeneID	`131000331`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000331`
原始查询	`SmilChr08G000752`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polycomb group protein FIE1-like
产物	polycomb group protein FIE1-like
Arabidopsis	`AT3G20740` (FIE) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821622] identity=74.7; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0137100` (FIE2) - identity=78.2; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000122 (negative regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0005515 (protein binding); GO:0031491 (nucleosome binding); GO:0035098 (ESC/E(Z) complex)
KEGG	smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000331

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782173.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057782173.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057782173.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782173.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782173.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5547424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:5549210`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B53,C80
`Chr8:5549210`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B53,C80
`Chr8:5550036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782173.1

370 aa

185

370

WD40

PF00400 WD40 121-157 aa PF00400 WD40 172-203 aa PF00400 WD40 343-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782173.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	121	157	3e-21	75.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057782173.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	172	203	3e-21	75.6	WD domain, G-beta repeat
`XP_057782173.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	343	365	3e-21	75.6	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926190.1
ATTTTAGTGGGTGAAACAACGACTTAGGTTCAAAATGTCGAAGACAACTCAGGTGGCTGTGTTGAAGACCCGAAGCCGAAACGCAAACCCTGCGGCCGATGGCTCGGATTCCGTTGGGTTGCGAGGCGGTGGCGGGATCGCTGACGCCGTCGAAGAAGCGGGAGTACAGGGTCACTAATAGGCTTCAGGAAGGCAAACGCCCCATTTACGCCGTTGTTTTCAATTTCATTGATTCCCGCTACTTCAACGCCTTCGCCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000331
ATGGCTCGGATTCCGTTGGGTTGCGAGGCGGTGGCGGGATCGCTGACGCCGTCGAAGAAGCGGGAGTACAGGGTCACTAATAGGCTTCAGGAAGGCAAACGCCCCATTTACGCCGTTGTTTTCAATTTCATTGATTCCCGCTACTTCAACGCCTTCGCCACCGCCGGCGGCAATCGCGTGACTGTCTACCAGTGTCTGGATGGTGGTGTTATAGCTGTGCTGCAATCCTACATTGATGAAGATAAGGATGAATCTTTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782173.1
MARIPLGCEAVAGSLTPSKKREYRVTNRLQEGKRPIYAVVFNFIDSRYFNAFATAGGNRVTVYQCLDGGVIAVLQSYIDEDKDESFYTVSWACNIDGTPFLVAGGLNGIIRVIDTGSEKIYKSFVGHGDSINEIRTQPLKPSLVVSASKDESVRLWNIHTGICILIFAGAGGHRNEVLSVDFHPSDIYRIASCGMDNTVKIWSMKEFWTYVEKSFTWTDLPSKFPTKYVQFPIFIASVHTNYVDCNRWIGDFMLSKSVDN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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