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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000758`

染色体: Chr08 坐标: 5585269-5593158 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000758`
名称	SmilChr08G000758
描述	la-related protein 1A-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5585269 - 5593158 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000338`
GeneID	`131000338`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000338`
原始查询	`SmilChr08G000758`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	la-related protein 1A-like
产物	la-related protein 1A-like
Arabidopsis	`AT5G21160` (LARP1a) LA RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832242] identity=47.2; qcov=0.762; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0266000` - identity=40.6; qcov=0.933; evalue=1.83e-150; confidence=medium
GO	GO:0000339 (RNA cap binding); GO:0048255 (mRNA stabilization)
KEGG	-
Pfam	PF05383 (La); PF21071 (LARP1_HEAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000338

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782185.1`
2	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	1.00000	`XP_057782185.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.80000	`XP_057782185.1`
4	P-body	P-body	0.80000	`XP_057782185.1`
5	Stress granule	Stress granule	0.20000	`XP_057782185.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5585772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:5586654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr8:5587450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,D1
`Chr8:5587515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr8:5587670`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	91	A10,A11,A15,A16,A18,A2,A21,A22,A23,A3,B10,B104,B108,B11,B112,B115,B117,B12,B125,B127,B13,B132,B134,B135,B137,B139,B14,B15,B16,B19,B22,B23,B31,B35,B37,B38,B39,B4,B42,B43,B48,B51,B53,B55,B58,B59,B64,B66,B67,B69,B7,B70,B73,B75,B78,B8,B81,B87,B97,B98,C15,C21,C22,C24,C28,C3,C31,C34,C36,C4,C42,C44,C45,C46,C48,C50,C58,C63,C64,C66,C67,C76,C78,C82,D1,D11,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr8:5589167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B86
`Chr8:5589254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B1,B22,B28,B86
`Chr8:5589399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr8:5590561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B86
`Chr8:5590568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B9,C39
`Chr8:5590599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B134,C20,C79
`Chr8:5590648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782185.1

917 aa

458

917

LARP1_HEAT

PF05383 La 310-365 aa PF21071 LARP1_HEAT 747-900 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782185.1`	Pfam	`PF05383`	La	Domain	310	365	3.4e-21	75.6	La domain
`XP_057782185.1`	Pfam	`PF21071`	LARP1_HEAT	Repeat	747	900	2.5e-58	197.1	LARP1 HEAT repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926202.1
TCAACATTATTCTGACCACTTTACAACCCTAGTCTCTCTCTCTCTCCAAACACACTCCTTCTTTACTGCCTCTTTCAGCCGGCTCCCGCCACCCTCTCCTCCACGCCCGCCGCCGTGCTCTCTCACTACTCATTCGGAATTCTCAAATTTACATTTATTTCACTAAATTTTACGAATCGACGTTTTTTATTATTTAATTCAGCGCACTCGTGGGGATGGGGGACAATGGGGTTAGTGATCTTGGTGATCGGCCCGAGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000338
ATGGGGGACAATGGGGTTAGTGATCTTGGTGATCGGCCCGAGAATCCGACTGACATCGCCGCCGGTGGTCCTCCGAGGTCGCCGTGGAAGACTTCGGCCACCGCGGCTCCGGTGGCCGGTGCTGATTCGGAGTCTTGGCCGGCACTGTCCGATGCGCAGCAGCGATCCAAGTGTAATGGAGGTGTCGATTTGAGCCCTGCTAAGTCGCCTCCCCTGCCGACGGAGTCTGGGACCGATAATTGTGCTGATCCTCCTGCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782185.1
MGDNGVSDLGDRPENPTDIAAGGPPRSPWKTSATAAPVAGADSESWPALSDAQQRSKCNGGVDLSPAKSPPLPTESGTDNCADPPAPVTVEPQKFHGRGNFKSPRRPYAAHHNKNGPKHGPNNIPPFAVPLPYHPPTIAPIFPSMVPISPSSVPGYSYQFPARSFPRADAQLLKSGSDPAQAYVPPMNGNIQPTPRADSRGHDSGSGGRRRSTNEQYGPTNPSRNNQRPASNNFYMQPNVGPRHFVRPPFFGPGIVDGPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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