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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000759`

染色体: Chr08 坐标: 5594915-5597792 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000759`
名称	SmilChr08G000759
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 13
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5594915 - 5597792 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000339`
GeneID	`131000339`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000339`
原始查询	`SmilChr08G000759`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 13
产物	transcription initiation factor TFIID subunit 13
Arabidopsis	`AT1G02680` (TAF13) TBP-associated factor 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837962] identity=70; qcov=0.873; evalue=1.04e-55; confidence=high
Rice	`Os01g0338100` - identity=77.9; qcov=0.825; evalue=1.04e-57; confidence=high
GO	GO:0006366 (transcription by RNA polymerase II); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02269 (TFIID-18kDa)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000339

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782186.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057782186.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782186.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782186.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782186.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5595600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B124,B127,B58
`Chr8:5596051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782186.1

126 aa

126

TFIID-18kDa

PF02269 TFIID-18kDa 28-116 aa

XP_057782187.1

126 aa

126

TFIID-18kDa

PF02269 TFIID-18kDa 28-116 aa

XP_057782188.1

126 aa

126

TFIID-18kDa

PF02269 TFIID-18kDa 28-116 aa

XP_057782189.1

126 aa

126

TFIID-18kDa

PF02269 TFIID-18kDa 28-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782186.1`	Pfam	`PF02269`	TFIID-18kDa	Domain	28	116	5.5e-30	104.0	Transcription initiation factor IID, 18kD subunit
`XP_057782187.1`	Pfam	`PF02269`	TFIID-18kDa	Domain	28	116	5.5e-30	104.0	Transcription initiation factor IID, 18kD subunit
`XP_057782188.1`	Pfam	`PF02269`	TFIID-18kDa	Domain	28	116	5.5e-30	104.0	Transcription initiation factor IID, 18kD subunit
`XP_057782189.1`	Pfam	`PF02269`	TFIID-18kDa	Domain	28	116	5.5e-30	104.0	Transcription initiation factor IID, 18kD subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926206.1
CTTTTTGTTTACTAAAATCTCTCTATTCTTACTGTCAAAAAAAAAAATTCTCTCCATTCTTCTTCGCTTCCAGAGATCCGGCGTCTCTTCGCCGTCGATTACCCTCATCACTCATCTCTCCATCCAATTTATCTCACTTATATCGGCCGTCCGGCGAGAAATCGCCGTCACCGCTGCTGTCCCGCCTCCTCCGGTCTACTCAGCAGTAGCAGCAGTTTCAAATTCCGGTATTGTAGGGAGGAGCTGTCAGATATAGAGGA...

XM_057926204.1
CTCTCTATTCTTACTGTCAAAAAAAAAAATTCTCTCCATTCTTCTTCGCTTCCAGAGATCCGGCGTCTCTTCGCCGTCGATTACCCTCATCACTCATCTCTCCATCCAATTTATCTCACTTATATCGGCCGTCCGGCGAGAAATCGCCGTCACCGCTGCTGTCCCGCCTCCTCCGGTCTACTCAGCAGTAGCAGCAGTTTCAAATTCCGGTATTGTAGAAACTGTAGGGAGGAGCTGTCAGATATAGAGGATGAGTAACA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131000339
ATGAGTAACACGACGGCAGGTCCCTCAAAAGTGAGGCCGGGATCATCCCAACCTTCAGAATCCTCCAAGCGTAAACGTGGAATGTTCCAGAAGGATTTGCAGCATATGATGTATGGATTCGGCGATGATGCTAACCCGCTTCCTGAGACTGTTGCACTTGTTGAGGATATTGTTGTGGAGTACGTCACAGAGATGGTCCATAAAGCTCAAGATATTGCATCTAAACGAGGAAAACTTATTATAGATGATTTCCTCTTCCA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057782186.1
MSNTTAGPSKVRPGSSQPSESSKRKRGMFQKDLQHMMYGFGDDANPLPETVALVEDIVVEYVTEMVHKAQDIASKRGKLIIDDFLFQIRKDIPKFNRCDELLSMNEELKQARKAFEVDEEKLASTD

XP_057782187.1
MSNTTAGPSKVRPGSSQPSESSKRKRGMFQKDLQHMMYGFGDDANPLPETVALVEDIVVEYVTEMVHKAQDIASKRGKLIIDDFLFQIRKDIPKFNRCDELLSMNEELKQARKAFEVDEEKLASTD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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