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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000779`

染色体: Chr08 坐标: 5735535-5742123 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000779`
名称	SmilChr08G000779
描述	probable glutamyl endopeptidase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5735535 - 5742123 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000360`
GeneID	`131000360`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000360`
原始查询	`SmilChr08G000779`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glutamyl endopeptidase, chloroplastic
产物	probable glutamyl endopeptidase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G47390` (AT2G47390) Prolyl oligopeptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819352] identity=74; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0307100` (OsPOP7) - identity=77.7; qcov=0.9; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00326 (Peptidase_S9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000360

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057782216.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057782216.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782216.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782216.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782216.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5735839`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B24
`Chr8:5735839`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B24
`Chr8:5735842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:5735988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr8:5737446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:5737455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:5737704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B68
`Chr8:5739610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C40
`Chr8:5739611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C40
`Chr8:5739649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B32,C40
`Chr8:5739664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:5739722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B130,B32,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782216.1

954 aa

477

954

Peptidase_S9

PF00326 Peptidase_S9 746-899 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782216.1`	Pfam	`PF00326`	Peptidase_S9	Domain	746	899	4e-20	73.0	Prolyl oligopeptidase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926233.1
AAAAAGGAGAAGAAAAAAAAAATATCTAGGAGCTCCTCCTCTAGTTCAACCATGTCCAATTGTTCCCTTCCATCTAAATTCTAATCCAGTGGCCGCCCGCAGCCAATCACAGCCCCGCCGCAGTAAGAGATTCCCCCTCAAAAAGCTAAGTAGTAAAAGGAATACGCAACTGCGCTTTTATCTAACGCCATTATTACTTCATTTTCTTTGGCTGTCCGCGCTAAAATGCGCCTTCACAAAGTCTACCACCGCTTCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000360
ATGCGCCTTCACAAAGTCTACCACCGCTTCTCTCTCTTCCATTCCCCCAAACAGCCCCTCATCATCTCCCACTCCCCCCACTCTCTCTCTCTAAAATCCCCCGACCGTCCTCCATTACAGTTGATCAAGCCTTTTTCGTCAACTTCGCCAGCTGCGGGTAGAGCGACGGCGATGAGACTCCGCAACATCGCCCCTCTCCACGCCGCCGAGGGCGACGTCGGCTCCAACGGCGCCGCTCCTGCTGCATCCGCCGCGGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782216.1
MRLHKVYHRFSLFHSPKQPLIISHSPHSLSLKSPDRPPLQLIKPFSSTSPAAGRATAMRLRNIAPLHAAEGDVGSNGAAPAASAAADSQDSSLGNGYRLPPPEIQNIVDAPPLPTISFSPHRDKILFLKRRSLPPLAELARPEEKLAGVRIDGKCNSRSRMSYYTGIGIYQLLNDGTLGPEKEVNGLPSGAKINFISWSNDGSHLAFSVRTDEEDGSSSKLRLWVAEIETGKARPLFQTPDIFLNAVFDNFVWVNNLTLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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