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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000787`

染色体: Chr08 坐标: 5802314-5806802 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000787`
名称	SmilChr08G000787
描述	uncharacterized SmilChr08G000787
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5802314 - 5806802 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000369`
GeneID	`131000369`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000369`
原始查询	`SmilChr08G000787`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HIT zinc finger and PAPA-1-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819348]; symbol=AT2G47350; hit=AT2G47350; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	HIT zinc finger and PAPA-1-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819348]; symbol=AT2G47350; hit=AT2G47350; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G47350` (AT2G47350) HIT zinc finger and PAPA-1-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819348] identity=43; qcov=1.06; evalue=6.88e-100; confidence=medium
Rice	`Os12g0561200` - identity=49; qcov=0.61; evalue=7.21e-73; confidence=high
GO	GO:0006338 (chromatin remodeling); GO:0031011 (Ino80 complex)
KEGG	-
Pfam	PF04438 (zf-HIT); PF04795 (PAPA-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000369

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782224.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057782224.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057782224.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782224.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782224.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5803295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B44,B79,C15,C26
`Chr8:5803298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:5803661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B56,B96
`Chr8:5803692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:5803915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B12,B123,B140,C34
`Chr8:5803965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,D4
`Chr8:5804035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B56,B96
`Chr8:5804077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B100
`Chr8:5805014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:5805032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr8:5805391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782224.1

505 aa

252

505

PAPA-1

zf-HIT

PF04795 PAPA-1 361-445 aa PF04438 zf-HIT 462-493 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782224.1`	Pfam	`PF04795`	PAPA-1	Family	361	445	8.6e-20	72.0	PAPA-1-like conserved region
`XP_057782224.1`	Pfam	`PF04438`	zf-HIT	Domain	462	493	5e-07	30.1	HIT zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926241.1
TGTAGTTGCAGCATAAATTTGTTGAAGAGAGAGAGAGGGGGATGGCAAAAAAGGAAGCAAATATGGGGCAGAGCAGCCCGAGTCAACTCGCCAGGACCTTACTGAGTCGCGAAGCCGAGTCCAAATATCCCCCACCCAAAAACAAACACACACAAAAATTTCACACACACACACCACATATACAAACAGGCGTGAAAAAAATGGAGAAGAAATTGGGAGTCTTCTTTACTACTACTATAGTAACCCCATATCAACAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000369
ATGGAACAATCTAGAGGCCCACCAATGGACGGTACGGGGGCTTCTATTAAAAAGAAGAGAAGCCAAACATCACGTCGACCTAGACCTGAAGGGCAACCACACCCTGATCAATCTCCTCTATCGGTGGCACCAGTTTCAGATGATATGAGTAAGGTCTCTAGTGATGAGAACATTGGCGATGGAAACTCTGGGGGGAAAATGTTCAATTTGAGTCAGTGTGTGTCGAGGTCCTTACCTGTTGGTGGATCAAATGGTACTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782224.1
MEQSRGPPMDGTGASIKKKRSQTSRRPRPEGQPHPDQSPLSVAPVSDDMSKVSSDENIGDGNSGGKMFNLSQCVSRSLPVGGSNGTVSNGTCDGAGSENRPKKVKLKVGGVTRTLQTKSSSNGESGSGSTAKASQSSDNARPRQRLIPQESSDEYHSPPLNKKSTLKGVPWKDFSKSSFTFARDEMGRASAKNANEKHGDKSDSVRKSRRVPKKRVLDGEFDEDDEDDEIRYLEKLKTSRMAGYKDLEAQSTRKLQKGVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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