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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000789`

染色体: Chr08 坐标: 5815315-5818008 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000789`
名称	SmilChr08G000789
描述	beta-carotene isomerase D27, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5815315 - 5818008 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000371`
GeneID	`131000371`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000371`
原始查询	`SmilChr08G000789`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-carotene isomerase D27, chloroplastic
产物	beta-carotene isomerase D27%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G01995` (AT4G01995) beta-carotene isomerase D27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828173] identity=64.3; qcov=0.706; evalue=4.75e-94; confidence=high
Rice	`Os05g0131100` - identity=64.7; qcov=0.712; evalue=2.82e-93; confidence=high
GO	GO:0005506 (iron ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF13225 (D27-like_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000371

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057782228.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057782228.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057782228.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782228.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782228.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5815449`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	129	A1,A10,A14,A15,A20,A22,A23,A24,A25,A6,A9,B1,B101,B102,B104,B107,B109,B11,B110,B113,B114,B119,B12,B121,B122,B124,B125,B128,B129,B130,B133,B134,B138,B140,B17,B2,B22,B23,B24,B26,B27,B31,B35,B37,B41,B42,B43,B44,B47,B50,B52,B53,B58,B59,B61,B62,B63,B66,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B78,B79,B8,B81,B84,B88,B90,B91,B92,B94,C10,C12,C14,C15,C16,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C30,C34,C37,C4,C44,C47,C48,C49,C5,C51,C53,C54,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C70,C71,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C85,C86,C87,D2,D3,D5,D6,D7
`Chr8:5815940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B95,C16,C23,C51
`Chr8:5816111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:5816292`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A10,A16,A3,B114,B28,B30,B40,B54,B60,C25,C32,C45,C68,D10
`Chr8:5817754`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	54	A10,A15,A23,A24,A25,A6,A7,B1,B104,B11,B111,B113,B119,B12,B120,B122,B130,B136,B22,B26,B31,B42,B43,B47,B51,B53,B61,B63,B69,B70,B76,B78,B84,B88,B91,C14,C19,C3,C30,C35,C37,C44,C46,C49,C58,C6,C65,C71,C75,C8,C83,C86,D11,D5
`Chr8:5817760`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A8,B21,B59,B64,C27,C65
`Chr8:5817817`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	110	A10,A14,A18,A2,A22,A24,A3,A5,A6,B10,B101,B109,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B12,B121,B122,B126,B127,B128,B130,B131,B133,B134,B135,B137,B138,B15,B17,B2,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B36,B45,B46,B50,B54,B55,B57,B59,B60,B63,B67,B69,B70,B71,B72,B75,B78,B80,B86,B87,B90,B91,B92,B94,B99,C10,C14,C16,C19,C2,C23,C24,C27,C28,C29,C31,C32,C37,C4,C43,C44,C46,C5,C53,C56,C60,C62,C66,C67,C68,C70,C75,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C86,C87,C9,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr8:5817839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782228.1

306 aa

153

306

D27-like_C

PF13225 D27-like_C 187-269 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782228.1`	Pfam	`PF13225`	D27-like_C	Domain	187	269	7.2e-35	119.5	Beta-carotene isomerase D27-like, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926245.1
AAAGCTTTTATATGTTTCCACAATAGTATTTATTTATTTTCTTCTTTTCTTATTATGATAATAATTCAATTTTTTCCCGATCCAAAAAAAAAAAAAAATTCAATTTTATTGCACACTCGATACAATCGGAGCACATGGGGCCAAATTATAAATTGTTGAACATTTGGGGGCTGAAGCGGCATTTCCCCATTATCACATTCCTCCACGTTTCTGATTCTGCTCCATTACAAATCGGAGCTGACGAGCGATTTTTTCCGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000371
ATGGGGCCAAATTATAAATTGTTGAACATTTGGGGGCTGAAGCGGCATTTCCCCATTATCACATTCCTCCACGTTTCTGATTCTGCTCCATTACAAATCGGAGCTGACGAGCGATTTTTTCCGGCTATGGCGTTTCTCGGCCACCGCCGCCCACTCATCTCACTCCCTTCTCTTCGCTCTCCCAAAACCAGCCATGCTGTTCTAATTTCTTGCTTCTCTAGCCGATCGAATTCTGTAGAAGCAGTTCAGTTGAAGACTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782228.1
MGPNYKLLNIWGLKRHFPIITFLHVSDSAPLQIGADERFFPAMAFLGHRRPLISLPSLRSPKTSHAVLISCFSSRSNSVEAVQLKTSSKEYSPGMIDDVFLNVFRSKMAQEIGWDSEKPGYDGLIDVAHRIMVGRSNSEATDAAVRILRSLFPPWLLELYKTLVSPIAGGKVASVMVARVTALSCQWLMGTCTVNSVEMPDGSSWPSGVYVEKCKYLEESKCVGVCINTCKLPTQTFFKDCMGVPLVMEPNFNDYSCQFK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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