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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000808`

染色体: Chr08 坐标: 5954832-5960629 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000808`
名称	SmilChr08G000808
描述	flowering time control protein FCA
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5954832 - 5960629 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000388`
GeneID	`131000388`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000388`
原始查询	`SmilChr08G000808`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	flowering time control protein FCA
产物	flowering time control protein FCA
Arabidopsis	`AT2G47310` (AT2G47310) flowering time control protein-related / FCA gamma-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819344] identity=39; qcov=0.847; evalue=1.37e-77; confidence=medium
Rice	`Os09g0123200` (OsFCA) - identity=56.2; qcov=0.478; evalue=1.03e-72; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF00397 (WW)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000388

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782244.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057782244.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782244.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782244.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782244.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5955131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B74,C25
`Chr8:5955298`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B39
`Chr8:5955298`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B39
`Chr8:5955402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:5956071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:5956078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:5956096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:5957128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B26,B99,C18
`Chr8:5957128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B99,C18
`Chr8:5958710`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B26,B88,B97,C18,C87
`Chr8:5958710`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B26,B88,B97,C18,C87
`Chr8:5959415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782244.1

406 aa

203

406

RRM_1

PF00076 RRM_1 96-164 aa PF00076 RRM_1 190-254 aa PF00397 WW 334-361 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782244.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	96	164	1.9e-30	105.3	RNA recognition motif
`XP_057782244.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	190	254	1.9e-30	105.3	RNA recognition motif
`XP_057782244.1`	Pfam	`PF00397`	WW	Domain	334	361	9.3e-10	39.1	WW domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926261.1
TAATAATTTTTATTTGTTTGGAGAAAATGAGTAATGAGTCTCACAAGTCAATGCCCCGAGTCGTTTTAGGGCTGGAATAGTAATTACCACATTCATCGGAAAACTCTATGGAGAGGCACGGTGGAGAGAGGCGCGCCGATCACTGCTCTCCGGCGATACCGTTTCCGGCAGACGGCGTCCACTACCATTATGACGACCGGCAGGACCACTTTCACGGAGGCCACCACCACCAGCACCAACCGGACCACCGCCACCACCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000388
ATGGAGAGGCACGGTGGAGAGAGGCGCGCCGATCACTGCTCTCCGGCGATACCGTTTCCGGCAGACGGCGTCCACTACCATTATGACGACCGGCAGGACCACTTTCACGGAGGCCACCACCACCAGCACCAACCGGACCACCGCCACCACCAAAATTTAAACGGCCAGCTGAATGAGTCCACTGGTTTCCACCTCAACGGCGACTCTAATCATTCGCTGCCTCTCTCGGGCCACAAGAGACCAATTCCTCACTCTAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782244.1
MERHGGERRADHCSPAIPFPADGVHYHYDDRQDHFHGGHHHQHQPDHRHHQNLNGQLNESTGFHLNGDSNHSLPLSGHKRPIPHSNNVDYGGFVKLYVVGIPRNATELDVSAVFGEFGDIIEVVLLKDKRTGLQQECCFVKYARIEQAQQAIGAFNTQYTIPGAAIPLKVKYAERELERLGSFGAHFHKLYVGCLNRQALKRDIEEIFSPYGVIEDIFIVKDEFRQNRGCGFVQYITRDMALAAIHGLNGTYVMRGCDQP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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