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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000813`

染色体: Chr08 坐标: 5985485-5986163 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000813`
名称	SmilChr08G000813
描述	serine/threonine-protein kinase Aurora-1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	5985485 - 5986163 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997989`
GeneID	`130997989`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997989`
原始查询	`SmilChr08G000813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase Aurora-1-like
产物	serine/threonine-protein kinase Aurora-1-like
Arabidopsis	`AT4G32830` (AUR1) ataurora1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829419] identity=79; qcov=0.6; evalue=1.03e-54; confidence=high
Rice	`Os01g0191800` - identity=66.4; qcov=0.689; evalue=2.48e-54; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005876 (spindle microtubule); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007052 (mitotic spindle organization); GO:0031616 (spindle pole centrosome); GO:0032133 (chromosome passenger complex); GO:0032465 (regulation of cytokinesis); GO:0051233 (spindle midzone)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997989

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779411.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779411.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779411.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779411.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779411.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:5985495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A3,C42
`Chr8:5985500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B17,B6,C21,C67
`Chr8:5985512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B80,B84
`Chr8:5985593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B80,B84
`Chr8:5985700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B6,C21,C67
`Chr8:5985710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B80
`Chr8:5985711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,C13,C29,C43
`Chr8:5985743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B91
`Chr8:5985778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B138,D8
`Chr8:5985788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A19,B28,C34,C56
`Chr8:5985788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B28,C34,C56
`Chr8:5985907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779411.1

190 aa

190

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 31-105 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 32-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779411.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	31	105	9.6e-16	58.7	Protein kinase domain
`XP_057779411.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	32	171	1.2e-10	41.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923428.1
ATGGCGATCGCGGCGGAGTCTCAACAGGAGCACAAGAATTCTTCAGAGAGCACAGCAGCAGAGAGAAAGAAATGGACCCTAAATGACTTCGACATCGGAAAGCCTCTTGGCCGAGGAAAGTTTGGGCATGTATATCTCGCTAGAGAAAAGAGGAGCAATCACGTTATCGCACTGAAGGTCTTGTTTAAGAGCCAGCTTAAAGAGTCTCAGGTTGAGCACCAGCTTCGTCGTGAAGTCGAGATACAGAGTCATCTTCGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997989
ATGGCGATCGCGGCGGAGTCTCAACAGGAGCACAAGAATTCTTCAGAGAGCACAGCAGCAGAGAGAAAGAAATGGACCCTAAATGACTTCGACATCGGAAAGCCTCTTGGCCGAGGAAAGTTTGGGCATGTATATCTCGCTAGAGAAAAGAGGAGCAATCACGTTATCGCACTGAAGGTCTTGTTTAAGAGCCAGCTTAAAGAGTCTCAGGTTGAGCACCAGCTTCGTCGTGAAGTCGAGATACAGAGTCATCTTCGACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779411.1
MAIAAESQQEHKNSSESTAAERKKWTLNDFDIGKPLGRGKFGHVYLAREKRSNHVIALKVLFKSQLKESQVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFYDQKRLVLPLVDSRRGCCCREFANSQALGDDQNAHKKERQQLKRAQLQASCDAASYMRNPMVSPLTAAARRILLKLTEEEFEFQSKPNAELLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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