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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000816`

染色体: Chr08 坐标: 6010319-6017260 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000816`
名称	SmilChr08G000816
描述	DUF724 domain-containing protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6010319 - 6017260 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000397`
GeneID	`131000397`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000397`
原始查询	`SmilChr08G000816`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF724 domain-containing protein 3-like
产物	DUF724 domain-containing protein 3-like
Arabidopsis	`AT1G09320` (AT1G09320) at domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837453] identity=34.8; qcov=0.283; evalue=1.78e-46; confidence=weak
Rice	`Os05g0132400` - identity=34.6; qcov=0.179; evalue=1.45e-27; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05266 (DUF724); PF05641 (Agenet)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000397

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782259.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782259.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782259.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782259.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782259.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6010852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr8:6010952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:6011321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:6011343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:6011506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr8:6011688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:6011956`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D5
`Chr8:6011956`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D5
`Chr8:6011958`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D5
`Chr8:6011958`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D5
`Chr8:6012237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,B89
`Chr8:6012625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782259.1

1147 aa

574

1147

Agenet

DUF724

PF05641 Agenet 36-106 aa PF05641 Agenet 188-247 aa PF05266 DUF724 960-1144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782259.1`	Pfam	`PF05641`	Agenet	Domain	36	106	1.9e-40	137.8	Agenet domain
`XP_057782259.1`	Pfam	`PF05641`	Agenet	Domain	188	247	1.9e-40	137.8	Agenet domain
`XP_057782259.1`	Pfam	`PF05266`	DUF724	Family	960	1144	7.2e-55	186.5	Protein of unknown function (DUF724)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926276.1
AGACAAACATTATGTCCAATACACAATTATTAAGCTTAAAAAGAAAGGGGGGAAAATTTCCCATTGCACTGAGAATGGGAATTTCCAAAAACCCTAGGGCTGCCCACTTGCGGCATTTTGGTGGCCACAAATTAGCGCATCTCAAATTTCACTCAAACAATGGGCGGTGATGCAGCGCAGCAGCTATTCGGAAAAACCCCATCCCAAATTACACCCCACTTCCACCGCCGCCCCGGCCGCCGCCGCTATCGCTACTTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000397
ATGGGCGGTGATGCAGCGCAGCAGCTATTCGGAAAAACCCCATCCCAAATTACACCCCACTTCCACCGCCGCCCCGGCCGCCGCCGCTATCGCTACTTCCCCGTAGGCTCCACGGTCGAGGTGCAGACCGACGAGGAGGATTTCAAGGGCGTCTTTTTCTCCGCCACCGTTCTCGCGCCGCCGAATTCACCGAAGAAGATCGGCCGGAAGAGGTCGAGGAAGCTCTACGTGGAGTACCACAACCTGCTTGCGCACGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782259.1
MGGDAAQQLFGKTPSQITPHFHRRPGRRRYRYFPVGSTVEVQTDEEDFKGVFFSATVLAPPNSPKKIGRKRSRKLYVEYHNLLAHEDGSDRLREYVEPSFVRPAPPLQEVVKGFDPDDAVDAFYKDGWWTGVVNQAVDDGKRYVVTFHSPPDELEFGLGELRPHWDWVNGNWVRPQRQNIAGLMFDVGRKVEVSFDREDFQDAWFPATILEELENQTFLVEYSSVNTDNHGHTKARVDSLHIRPCPPLLKDKNFVLLEKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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