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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000826`

染色体: Chr08 坐标: 6106298-6108060 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000826`
名称	SmilChr08G000826
描述	galactinol synthase 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6106298 - 6108060 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000409`
GeneID	`131000409`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000409`
原始查询	`SmilChr08G000826`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	galactinol synthase 1-like
产物	galactinol synthase 1-like
Arabidopsis	`AT2G47180` (GolS1) galactinol synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819331] identity=77.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0316200` (OsGolS1) - identity=75.8; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000409

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782277.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057782277.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782277.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782277.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782277.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6106599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr8:6106614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B25,B56,B96,C81
`Chr8:6107029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B32,B98
`Chr8:6107129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr8:6107210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B21,B59,B64,C27
`Chr8:6107219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C81
`Chr8:6107322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B1,B10,B105,B121,B32,B45,B59,B63,B70,B83,C15,C21,C74,C80
`Chr8:6107352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,C3,C65,C70
`Chr8:6107415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:6107634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B66,C67
`Chr8:6107704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C45
`Chr8:6107709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C22,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782277.1

329 aa

164

329

Glyco_transf_8

PF01501 Glyco_transf_8 21-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782277.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	21	263	3.6e-45	155.2	Glycosyl transferase family 8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926294.1
TTTCATAGCTATATAAACACTACTCCTATCACTCCAAAAATATTACCAAGAAACCAAATTAATTTAGAAATTAAGCCCTCTCTTTCAGTTTCAGCAAAGTAAAAAGAAGATTCAATTTAGTTTTCCCTCTTCAAACAAAAAAGAACCAACTTCAAATTCACCTCTTTTTTAGCAATACATCCCATGGCTCCCGAGCTCGTTACCGCGGCGAAACCGGCGGCTGTGGCGTCGAGGGCCTACGTGACTTTCTTGGCCGGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000409
ATGGCTCCCGAGCTCGTTACCGCGGCGAAACCGGCGGCTGTGGCGTCGAGGGCCTACGTGACTTTCTTGGCCGGCAACGGGGACTACGTGAAGGGCGTGGTGGGGCTGGCCAAGGGCCTGCGGAAGGTGAAGGCGGCGTATCCTCTCGTGGTGGCGGTGCTGCCCGACGTGCCGGAGGAGCACCGCCGCACACTGGTGGAGCAAGGCTGCATAGTTAGGGAGATCGTGCCCGTTTACCCGCCGGAAAACCAGACGCAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782277.1
MAPELVTAAKPAAVASRAYVTFLAGNGDYVKGVVGLAKGLRKVKAAYPLVVAVLPDVPEEHRRTLVEQGCIVREIVPVYPPENQTQFAMAYYVINYSKLRIWEFVDYTKMIYLDGDIQVYENIDHLFDLEDGYLYAVMDCFCEKTWSHTRQYKIGYCQQCPEKVTWPAEMGAPPALYFNAGMFVFEPSLATYESLLDTLKITTPTCFAEQDFLNMFFKDVYKPIPNVYNLVLAMLWRHPENVQLEQVKVVHYCAAGSKPW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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