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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000846`

染色体: Chr08 坐标: 6280411-6283130 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000846`
名称	SmilChr08G000846
描述	peter Pan-like protein
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6280411 - 6283130 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000426`
GeneID	`131000426`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000426`
原始查询	`SmilChr08G000846`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peter Pan-like protein
产物	peter Pan-like protein
Arabidopsis	`AT5G61770` (PPAN) PETER PAN-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836299] identity=78.4; qcov=0.874; evalue=2.58e-178; confidence=high
Rice	`Os03g0343700` - identity=62.3; qcov=0.828; evalue=4.34e-135; confidence=high
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0019843 (rRNA binding); GO:0030687 (preribosome, large subunit precursor)
KEGG	-
Pfam	PF04427 (Brix)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000426

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782311.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057782311.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.80000	`XP_057782311.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057782311.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782311.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6280800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:6281616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C16
`Chr8:6281644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B94,C33,C61,D10
`Chr8:6281783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:6281885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B94,C33
`Chr8:6282539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C22,D1
`Chr8:6282560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C22,D1
`Chr8:6282839`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B35,B94,C61
`Chr8:6282839`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B35,B94,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782311.1

349 aa

174

349

Brix

PF04427 Brix 44-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782311.1`	Pfam	`PF04427`	Brix	Domain	44	286	1.2e-43	150.1	Brix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926328.1
GAATTATGCTTCAGCAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAATTGCTTCATATAAAATGCTCATAGAATAAAACCTAAAACCCTCTTGCTAAAACCCGTGTCTCGTATCGTCGCCGGTGTTGGGCTTCCATCTGTTTTCCTTCTTCGAATTGCTTCATTTTCTAACCTTTATCTGTTGTTTCTCTTCTTGATTTCTTCTGTCATGGCTCGATTTCGTAAAAATAAGAGGATTCCCTTTGTCAGACCGATTGGTAAGAAGCAGGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000426
ATGGCTCGATTTCGTAAAAATAAGAGGATTCCCTTTGTCAGACCGATTGGTAAGAAGCAGGCCTCTGTAGACCATGTAACGGGAGACAAGATTCCGAAGAGTTTCGTGTTTGCTCGAGGCAAATTGCCCGCTGTTCTGAGACAATTGCAAATTGATTTGAGAAAATTGATGCTTCCTTTCACTGCTTTGAAGCTCAAGGAAAAAAAGCGTAACAACATCAAAGACTTCTTGAATGTTGCTGGACCAATGGGAGTTACTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782311.1
MARFRKNKRIPFVRPIGKKQASVDHVTGDKIPKSFVFARGKLPAVLRQLQIDLRKLMLPFTALKLKEKKRNNIKDFLNVAGPMGVTHFLILSKTESSPYLRVARTPQGPTLTFKIHGYSLAADVVKSQLRPRCHKDLFQNPPLIVLSGFGTGEQHLKLTTIMFQNIFPAIDINTVKLSSCQRIVLLNYNKDTKLIDFRHYSIRLQPVGVSRRVRKFVQNHQVPDLRSLQDVSEFLTRAGYGSESEVDDEAATVTLPTDLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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