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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000849`

染色体: Chr08 坐标: 6289574-6297875 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000849`
名称	SmilChr08G000849
描述	DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH8
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6289574 - 6297875 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000424`
GeneID	`131000424`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000424`
原始查询	`SmilChr08G000849`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH8
产物	DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH8
Arabidopsis	`AT2G47680` (AT2G47680) zinc finger (CCCH type) helicase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819381] identity=56.6; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0256800` (OsC3H4) - identity=52.9; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005622 (intracellular anatomical structure); GO:0005730 (nucleolus); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C); PF00642 (zf-CCCH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000424

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782307.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782307.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057782307.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782307.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782307.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6289723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B126,C45,C57,C80
`Chr8:6289723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,C45,C57,C80
`Chr8:6289766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:6290486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:6290718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:6291491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr8:6291495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr8:6291527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:6291589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:6291840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,A7,B75,C23,C46
`Chr8:6292414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr8:6293972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B120,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782307.1

1020 aa

510

1020

DEAD

Helicase_C

zf-CCCH

PF00270 DEAD 37-186 aa PF00271 Helicase_C 273-389 aa PF00642 zf-CCCH 736-756 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782307.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	37	186	1.3e-08	35.5	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057782307.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	273	389	3.5e-12	47.2	Helicase conserved C-terminal domain
`XP_057782307.1`	Pfam	`PF00642`	zf-CCCH	Family	736	756	3e-06	27.7	Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926324.1
GTACGTGGGGAAAAAAATACACCACTTTAAGCGCCCACTCGCCGAGGAGCGCGTCGGAATCCGTACCATCAGTTGAGTTCCACGTACAAGCACTCGGTGCACGGGAAAGCCTATAAACCAGAATAGACTTTTCGTTTACTCAGACAGTAGAAAGCCTTCTCCACAGCTCCACTACACACCATTTTTCCGAGGGTTTTTGCTGGTTGCCGAAGTTTGTTTACAGTGCACGAATCAATGGCGTCTCCTTCGGCGCCGTCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000424
ATGGCGTCTCCTTCGGCGCCGTCCTCGTCTTCTCCGACGCCGTCCTCTTCTTCGACGCTCTCCGCGTCTCAGTCGAGTTTCTCCGAACTTCCGGTGGCGGCGATGCGAAGTAAGATTGTCGAGAAGATTTTGGAGAACCGCGTCACTCTTATCGTCGGCGAAACCGGCTGCGGAAAGAGCTCCCAGATCCCACAGTTCCTACTGGATGAAAGTATAGAGCCCATACTTTGCACACAACCGAGGAGATTTGCTGTTGTAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782307.1
MASPSAPSSSSPTPSSSSTLSASQSSFSELPVAAMRSKIVEKILENRVTLIVGETGCGKSSQIPQFLLDESIEPILCTQPRRFAVVAVARMVANARNCEIGGEVGYHIGHSRVFSASSKIVFKTAGVLLDEMREKGFKALRYKVIVLDEVHERSVESDLVLVCIKQFLLRNKDLRLVLMSATADISRYREYFRDLGRDERVEVLAIPSTEKNTIFQRKVLYLEQISELLGMEHENLSLKYCSAPSPKMAQADLNPEVHKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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