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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000854`

染色体: Chr08 坐标: 6331377-6333570 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000854`
名称	SmilChr08G000854
描述	APO protein 3, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6331377 - 6333570 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000440`
GeneID	`131000440`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000440`
原始查询	`SmilChr08G000854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	APO protein 3, mitochondrial-like
产物	APO protein 3%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G61930` (APO3) APO RNA-binding protein (DUF794) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836314] identity=43.6; qcov=0.988; evalue=1.97e-99; confidence=medium
Rice	`Os04g0615500` (OsISC39) - identity=44.9; qcov=0.844; evalue=2.02e-93; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF05634 (APO_RNA-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000440

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057782330.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057782330.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782330.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782330.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782330.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6331788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C54
`Chr8:6331878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:6331893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:6332330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr8:6332826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B61,D8
`Chr8:6332845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr8:6332914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B61
`Chr8:6332942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:6333045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C82,D10
`Chr8:6333060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:6333062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B132,D11
`Chr8:6333070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782330.1

404 aa

202

404

APO_RNA-bind

PF05634 APO_RNA-bind 38-225 aa PF05634 APO_RNA-bind 266-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782330.1`	Pfam	`PF05634`	APO_RNA-bind	Family	38	225	7.4e-81	271.1	APO RNA-binding
`XP_057782330.1`	Pfam	`PF05634`	APO_RNA-bind	Family	266	382	7.4e-81	271.1	APO RNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926347.1
AAAAAATCAAGTTATCTCTAGTTTGACCGCCAACTTTTGCTGTTCGGCCGCCGCCTCCAAGAAGTGCAACCCAGGTGGATCGCCCCACCCCGCCGCCTGCCCACCGGCAGCGATGAACACAAACAGAGAAGCACACACAGTTATGGCAGGAGCCCAAACTGCAGCGTAAATTATTACATCTGCAATTTTACAAAGCAGAAGCACTCATTCATCCCCTTTTTCGTCACTTACTTCCCCTCTTAACTTAGCTCATGCCACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000440
ATGTTCCACACACGCCTTCGAACAATGTTCCGTCAACACCAATCGCTCGCGCGGAGTGTGAATTTTTCAGCTGAGACCTGTTCGCCTCGTGCACTATGCCCTGCTACTGCCTCCGATTTCGTTGAGCTGCCGCGAAAGCTGAAACGGTCTGAGCGGAAGCCATGGGTGACCGACGTCACCGAACTCAAGCGTCGAGAGAGATGGAGAAGACAAGCGAGGAGGGTTGTTCGAGAGGTCAAGTTAAAGCCTCCCGATAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782330.1
MFHTRLRTMFRQHQSLARSVNFSAETCSPRALCPATASDFVELPRKLKRSERKPWVTDVTELKRRERWRRQARRVVREVKLKPPDNGLLVKELIPVARDVLAARTRLLSCVSRVSDSVPIFVCRVCGDVHIGDPPHKIRSCDVSGSLKSKEHVWKRGGVDCIVPVVESFHLYDRLGRAVSHEERLEVDRVPAILELCIQGGVDMPEYPTRRRDFPVYLVAGRLIDFEKRFPKNGFSGKDINIRTSGFWQMRKRLNEDRGP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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