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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000857`

染色体: Chr08 坐标: 6349574-6351496 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000857`
名称	SmilChr08G000857
描述	uncharacterized SmilChr08G000857
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6349574 - 6351496 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000443`
GeneID	`131000443`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000443`
原始查询	`SmilChr08G000857`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleolar-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839496]; symbol=AT1G02870; hit=AT1G02870; species=arabidopsis; confidence=high
产物	nucleolar-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839496]; symbol=AT1G02870; hit=AT1G02870; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G02870` (AT1G02870) nucleolar-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839496] identity=64.8; qcov=1.02; evalue=3.45e-89; confidence=high
Rice	`Os05g0367100` - identity=61.3; qcov=0.984; evalue=2.91e-72; confidence=high
GO	GO:0005730 (nucleolus); GO:0042273 (ribosomal large subunit biogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF09420 (Nop16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000443

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782334.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057782334.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782334.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782334.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782334.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6349747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B76,C80
`Chr8:6349753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A3,C42
`Chr8:6349801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B5,B9
`Chr8:6349954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:6349966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B88
`Chr8:6349969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B72,C33,C46,C65
`Chr8:6350021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,B89,C1
`Chr8:6350035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B124,B99,C42
`Chr8:6350038`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A5,B19,B34,B49,B81,B92,C41,C55,C87
`Chr8:6350912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr8:6350927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,C59,D2
`Chr8:6350941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,C3,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782334.1

189 aa

189

Nop16

PF09420 Nop16 109-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782334.1`	Pfam	`PF09420`	Nop16	Family	109	176	8.7e-23	82.2	Ribosome biogenesis protein Nop16

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926351.1
CTGAGTTTTTTCGTAGAATGAAAAAATAATATTAAATGGTGACAAGACAACATAACCCTCTAACCATATACTAGTACAGTAGTATTATATCAAGAAGTTGGAAGGTTAAGTTGGACTTTTCCGTATTTAGAAAGAATTAGTTAAGCTTTGTAAATCACTAGTTACAGTGACGACTTATTTAGATTGGAATAATACGCAACGTATTGTTAAACCCTAGCCCCCTTTCTCCAAAAACCCTAATTTCCGCAAACCAGAGGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000443
ATGGGTGGTTCGCGGCGGAAGTACAAGCGATCAAGGGCGAAAGTACAAGTGGGACTGCCGAAGAAAAACCCCCACATATTCAAGCCGGCGTTCAATCTCCCACCGAAATTGAAAGCTCTGCTCGACCCCCTCTCGAAGTGGGATGAGAAGGGCAGCGTCATCGAGAATTACAAGTCGTTCGGCGTCGTTTCCAATCCCAATTACCTCGGCGTGCGGTCGCGGACGCCTCACATCGTCGAGAGTGATGATCTCCAGATGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782334.1
MGGSRRKYKRSRAKVQVGLPKKNPHIFKPAFNLPPKLKALLDPLSKWDEKGSVIENYKSFGVVSNPNYLGVRSRTPHIVESDDLQMPPDSDIAVSEFDPIDSGSDLEEDDLKSALGKKRTDGKQPSLQPLTATQRLHVSRLVEKYGDDYQSMFMDIKLNKMQHSVATLEKLCKRYHIYKDKNPLLVGTK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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