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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000859`

染色体: Chr08 坐标: 6371967-6374546 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000859`
名称	SmilChr08G000859
描述	uncharacterized protein OsI_027940-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6371967 - 6374546 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000446`
GeneID	`131000446`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000446`
原始查询	`SmilChr08G000859`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0359500; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0359500; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G02450` (AT4G02450) HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828006] identity=66.1; qcov=0.729; evalue=3.98e-55; confidence=high
Rice	`Os08g0359500` - identity=68.2; qcov=0.776; evalue=9.21e-61; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0006457 (protein folding); GO:0051087 (protein-folding chaperone binding); GO:0051131 (chaperone-mediated protein complex assembly); GO:0051879 (Hsp90 protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF04969 (CS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000446

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782337.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782337.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057782337.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057782337.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782337.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6373766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:6373906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,D3
`Chr8:6374282`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	B42,B43
`Chr8:6374282`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr8:6374325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782337.1

170 aa

170

PF04969 CS 5-81 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782337.1`	Pfam	`PF04969`	CS	Domain	5	81	3e-11	44.8	CS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093736.1
GATTCGTCAAATACGTACTTTGGCTCTAGCAGTATCGCGAGCCTTCTGGAAACTGTTTTCCCGGCAAAAATTCACCTCTTTAAATGCAGTAATTTTTTTAGGCGGTTTTAAATGCAATTCTGCTTCTGGAGTCTACCATTTTGTATTGTTGTTTACTCTCTTAAGTTTCTAACTCTATCCCTAATCCTATTTGGAAGTTGAAAATGAGCCGGCATCCTGAAGTGAAGTGGGCTGAACGGGAGGATAAGGTGTTTCTTACC...

XM_057926354.1
AGATTCGTCAAATACGTACTTTGGCTCTAGCAGTATCGCGAGCCTTCTGGAAACTGTTTTCCCGGCAAAAATTCACCTCTTTAAATGCAGTAATTTTTTTAGGCGGTTTTAAATGCAATTCTGCTTCTGGAGTCTACCATTTTGTATTGTTGTTTACTCTCTTAAGTTTCTAACTCTATCCCTAATCCTATTTGGAAGTTGAAAATGAGCCGGCATCCTGAAGTGAAGTGGGCTGAACGGGAGGATAAGGTGTTTCTTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000446
ATGAGCCGGCATCCTGAAGTGAAGTGGGCTGAACGGGAGGATAAGGTGTTTCTTACCGTGGTGCTTCCAGATGCTAAGAATCCTAAGGTCAATGTTGACCCAAATGGAACATTCACGTTTTCAGCCTCTGCTGGGACAGACAACAATCTTTATGAGCTCAAACTAGATCTTCTTGATAAAATCAATGTAGAGGAGAGCAAAATAAGCATTGGTGTGAGGAACATATTCTGTGTCTTGGAGAAAGCTGAAAACAAATGGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782337.1
MSRHPEVKWAEREDKVFLTVVLPDAKNPKVNVDPNGTFTFSASAGTDNNLYELKLDLLDKINVEESKISIGVRNIFCVLEKAENKWWKKLLRGDEKIHYVKVDWDKWVDEDDEIGGGAGDLDLGGMDFSKFGDMGLGDDTVGDEYEESDNEEVKQPEEEKVDDAAPGEAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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