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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000860`

染色体: Chr08 坐标: 6375022-6378124 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000860`
名称	SmilChr08G000860
描述	WD repeat-containing protein GTS1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6375022 - 6378124 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000445`
GeneID	`131000445`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000445`
原始查询	`SmilChr08G000860`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WD repeat-containing protein GTS1
产物	WD repeat-containing protein GTS1
Arabidopsis	`AT2G47790` (AT2G47790) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819391] identity=66.5; qcov=0.893; evalue=2.78e-178; confidence=high
Rice	`Os12g0294100` (OsWD40-197) - identity=65.4; qcov=0.447; evalue=1.91e-80; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000445

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782336.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782336.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782336.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782336.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782336.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6375119`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	62	A1,A14,A15,A22,A23,A4,A6,B102,B104,B108,B110,B114,B119,B123,B124,B126,B130,B131,B135,B15,B18,B22,B26,B28,B29,B49,B6,B61,B64,B66,B69,B70,B81,B85,B99,C11,C21,C24,C3,C30,C32,C34,C37,C41,C44,C45,C47,C5,C52,C57,C58,C63,C67,C68,C69,C73,C75,C76,C80,C83,D4,D6
`Chr8:6375133`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	57	A2,A20,A22,A25,A7,B10,B109,B12,B124,B125,B127,B129,B13,B133,B136,B14,B140,B16,B2,B21,B27,B29,B3,B41,B46,B61,B65,B72,B75,B79,B8,B82,B99,C19,C21,C26,C27,C32,C36,C43,C44,C46,C48,C49,C56,C6,C65,C70,C77,C78,C81,C84,C86,C87,C9,D4,D7
`Chr8:6375157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr8:6375602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:6377341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A11,A14,A16,A23,B100,B108,B115,B31,B42,B43,B48,C25,C50,C54,C59,C62,C65,C9
`Chr8:6377370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B68,C18,C8,D11
`Chr8:6377676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr8:6377775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B128,B44,C26,C71
`Chr8:6377805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:6377836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B68,C18,C8,D11
`Chr8:6377918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A10,A15,A2,A25,B1,B110,B113,B119,B122,B128,B17,B19,B23,B30,B32,B33,B37,B44,B45,B52,B54,B66,B68,B69,B80,B86,B87,B9,B94,B99,C12,C15,C28,C40,C47,C55,C61,C7,C70,C76,C85,D11
`Chr8:6377946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B24,B53,D5,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782336.1

421 aa

210

421

WD40

PF00400 WD40 104-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782336.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	104	143	2.4e-11	44.4	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926353.1
GGGAGTTAAGAAATCATAATTAGTTTTCTCTAAAAAGGAACAAAAAAAAAAAAGAAATCAAAGCAATTTTATTTATTGTTTAGAAAAGGAAAAAAAAATGGTGATGTATGATAAAACAATCCATTCCAATCTCCGCAAAAACCCTAGCTCCAACGAAAAACCACCCAGGCGGAACAGAACACGAAAGCGAAAAAAAGAGAGCATGGAAATTGCAGAAGAAATGGAGATAGAAGAGAAAACTCCAACTCCTAGTCCAAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000445
ATGGTGATGTATGATAAAACAATCCATTCCAATCTCCGCAAAAACCCTAGCTCCAACGAAAAACCACCCAGGCGGAACAGAACACGAAAGCGAAAAAAAGAGAGCATGGAAATTGCAGAAGAAATGGAGATAGAAGAGAAAACTCCAACTCCTAGTCCAAGCAATTTCAAGAGATTTGGGCTAAAAAACTCAATACAAACCAACTTCGGTGATGATTACGTCTTCGAAATTGTTGCCAAAGACGATTGGACGTCGATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782336.1
MVMYDKTIHSNLRKNPSSNEKPPRRNRTRKRKKESMEIAEEMEIEEKTPTPSPSNFKRFGLKNSIQTNFGDDYVFEIVAKDDWTSIAVSLSTNAVKLYSPQTGQYLGECSGHSSTINKISFAGPSSPHVLYSCSSDSTIRAWDSRSFQQVACISAGPSEEVFSFSFGGADGNLIAAGCNSQILVWDWRTMKQTACLEESHMEDVTQVHFVPGHQNKLLSASVDGLMCLFDTSGEINDDDHMVSVFNVGTSIGKVGFCGQA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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