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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000897`

染色体: Chr08 坐标: 6636724-6641671 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000897`
名称	SmilChr08G000897
描述	uncharacterized SmilChr08G000897
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6636724 - 6641671 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000482`
GeneID	`131000482`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000482`
原始查询	`SmilChr08G000897`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	catalytics [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828041]; symbol=AT4G03200; hit=AT4G03200; species=arabidopsis; confidence=high
产物	catalytics [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828041]; symbol=AT4G03200; hit=AT4G03200; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G03200` (AT4G03200) catalytics [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828041] identity=72.8; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0935600` - identity=68.1; qcov=0.384; evalue=2.26e-147; confidence=low
GO	GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF03190 (Thioredox_DsbH); PF13899 (Thioredoxin_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000482

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057782384.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782384.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782384.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782384.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782384.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6636973`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B128,B30
`Chr8:6636973`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B128,B30
`Chr8:6636986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B12,B63,C16,D2
`Chr8:6636987`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B134,C11,C23,C69,C79
`Chr8:6636987`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B134,C11,C23,C69,C79
`Chr8:6637108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:6637388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C55,D4
`Chr8:6637571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,C43,C44,C57,C61
`Chr8:6637624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B7
`Chr8:6637631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B140,C2,C4,C82
`Chr8:6637642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:6637799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B113,B95,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782384.1

807 aa

404

807

Thioredox_DsbH

Thioredoxin_7

PF03190 Thioredox_DsbH 71-227 aa PF13899 Thioredoxin_7 91-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782384.1`	Pfam	`PF03190`	Thioredox_DsbH	Family	71	227	8e-77	257.5	Protein of unknown function, DUF255
`XP_057782384.1`	Pfam	`PF13899`	Thioredoxin_7	Domain	91	156	5.2e-10	40.0	Thioredoxin-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926401.1
TTTTTCTGCCACGTACAACATCAGCTTCGTCACCACTACCAAATGGCAATTGTCAAACTCCCTCCCTAATTTTCTTTCGGCAACTCTATAAATTCTCTACATTTTCGATCAATTCCTTTTCTTTTCTTCACTAATATGCTCAAAAGACTTCTCATTTCTCGCCGCTTCATCTGTCATTACAAACCCACCTATAATTCGGCGAAGAAACCCGACAATTCGGAATCCTTTCCATTTTCTTGGCCGTTATCGGTGGTTTCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000482
ATGCTCAAAAGACTTCTCATTTCTCGCCGCTTCATCTGTCATTACAAACCCACCTATAATTCGGCGAAGAAACCCGACAATTCGGAATCCTTTCCATTTTCTTGGCCGTTATCGGTGGTTTCTTGCCGGCCCATCAACTTTTCTAGAGTTCTTGCCATGGCGGATGGCGGGTCCCCCCCTAAAACCGCGTCGTCGAAGCCCCAGAAGCACACTAACCGGCTTGCAGCGGAGCACAGTCCTTACCTTCTTCAACATGCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782384.1
MLKRLLISRRFICHYKPTYNSAKKPDNSESFPFSWPLSVVSCRPINFSRVLAMADGGSPPKTASSKPQKHTNRLAAEHSPYLLQHAHNPVDWYPWGEEAFAEARKRDTPIFLSIGYSTCHWCHVMEVESFEDEEVAKLLNDWFVSIKVDREERPDVDKVYMTYVQALYGGGGWPLSVFLSPDLNPLMGGTYFPPDDKYGRPGFKTVLRKVKEAWDTKKESMVKGGAFAIEQLSEALAAVAMSEKLPDGLPERAVQKCAEQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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