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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000898`

染色体: Chr08 坐标: 6642456-6647915 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000898`
名称	SmilChr08G000898
描述	peptide chain release factor APG3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6642456 - 6647915 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000486`
GeneID	`131000486`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000486`
原始查询	`SmilChr08G000898`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide chain release factor APG3, chloroplastic
产物	peptide chain release factor APG3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G62910` (APG3) Peptide chain release factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825466] identity=80.4; qcov=0.889; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0657100` - identity=81.2; qcov=0.889; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006415 (translational termination); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization); GO:0010027 (thylakoid membrane organization); GO:0016149 (translation release factor activity, codon specific); GO:0032544 (plastid translation)
KEGG	-
Pfam	PF00472 (RF-1); PF03462 (PCRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000486

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057782389.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057782389.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782389.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782389.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782389.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6642742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:6642951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B103,B132,C21
`Chr8:6643976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B80
`Chr8:6644495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:6645964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B118,B37,C18,C6
`Chr8:6645969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B11,B110,B80,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782389.1

414 aa

207

414

PCRF

RF-1

PF03462 PCRF 60-254 aa PF00472 RF-1 261-371 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782389.1`	Pfam	`PF03462`	PCRF	Domain	60	254	9.2e-72	241.7	PCRF domain
`XP_057782389.1`	Pfam	`PF00472`	RF-1	Domain	261	371	1.6e-37	128.7	RF-1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926406.1
TAAAATCGCTACTGCTAACCTACGATTTATTCTTTAATAGTAGTATATAGTACGGAAAATATAAAAGATTGTGAAAATATTCATTCGCGCGTTTTATCCAATTATCCTAAACTCAGCCGCTAGCACGATGACCAGTTTAACGGCGAGCTTCGCCGCTCGTTTCTCCTCCGCCACCGCGCATTTGCCGGCGGGGAGTCGCGTTCCGCGGCGTGCGTTCTTCCTGCAGCCTCCGACCCGACGCTGTCGTTCGGGAAGAATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000486
ATGACCAGTTTAACGGCGAGCTTCGCCGCTCGTTTCTCCTCCGCCACCGCGCATTTGCCGGCGGGGAGTCGCGTTCCGCGGCGTGCGTTCTTCCTGCAGCCTCCGACCCGACGCTGTCGTTCGGGAAGAATAGTGTGCTCGGCGGAACCATATTTAATATCGAAATTAGAGTCCGCTGAGAAGACGTGGAAGGAATTATCGGTTAGACTGGCTGATCCAGATGTAGCCTCAAATCCAAGTGAGTATCAGAAATTAGCACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782389.1
MTSLTASFAARFSSATAHLPAGSRVPRRAFFLQPPTRRCRSGRIVCSAEPYLISKLESAEKTWKELSVRLADPDVASNPSEYQKLAQSLAELDEVVETFRSFKDCQKQLEEAKALAKEAGNDEDMVEMINSEIASLANQIKELEERLKLLLLPTDPLDARNILLEVRAGTGGDEAGLWAGDLVRMYEKYSERNSWKFSPVSSSEAEYGGYKTYVMEIKGKRVYSKLKYESGVHRVQRVPRTETQGRVHTSTATVAIMPEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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