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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000903`

染色体: Chr08 坐标: 6688781-6689846 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000903`
名称	SmilChr08G000903
描述	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit T, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6688781 - 6689846 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000489`
GeneID	`131000489`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000489`
原始查询	`SmilChr08G000903`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit T, chloroplastic
产物	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit T%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G09350` (NdhT) Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826517] identity=66.7; qcov=0.922; evalue=3.14e-100; confidence=high
Rice	`Os11g0216100` - identity=64.2; qcov=0.872; evalue=8.42e-89; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000489

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057782394.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057782394.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057782394.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782394.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782394.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6688972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,B15,C42,D2
`Chr8:6689019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B8,C27,C84
`Chr8:6689393`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	57	A10,A14,A15,A19,A20,A23,A25,A7,B107,B112,B119,B122,B126,B130,B139,B14,B20,B23,B26,B28,B29,B31,B38,B39,B40,B41,B42,B5,B52,B57,B61,B70,B73,B75,B81,B86,B88,B89,B98,C15,C17,C18,C23,C32,C36,C43,C44,C45,C48,C52,C54,C60,C62,C68,C7,C8,C84
`Chr8:6689441`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A14,A19,A25,A4,B104,B112,B117,B119,B125,B129,B130,B14,B20,B26,B3,B38,B4,B40,B45,B5,B52,B54,B57,B58,B62,B65,B86,C10,C15,C17,C23,C30,C32,C39,C43,C44,C47,C48,C52,C7,C83,C84,C86,D2,D8
`Chr8:6689509`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	180	A1,A10,A11,A13,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A23,A24,A3,A4,A7,A8,A9,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B109,B11,B111,B112,B113,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B13,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B47,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B61,B64,B66,B67,B69,B7,B72,B75,B76,B77,B8,B80,B82,B84,B9,B93,B94,B95,B96,B97,B98,C12,C13,C14,C15,C16,C19,C2,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C46,C47,C49,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C70,C71,C72,C74,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C85,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D8
`Chr8:6689513`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B47,C1,C65
`Chr8:6689513`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B47,C1,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782394.1

218 aa

109

218

DnaJ

PF00226 DnaJ 76-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782394.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	76	139	1.2e-21	77.3	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926411.1
TCTTTTTGTCAGGACTAACAACAAAACCCCACTTGAAAACAACTCCAGCAAGAATCCAGAGCCACACAGAAAGATGAGGTGGTGAAACCTCTGCTCCTGGTCTGAATTCTGAATCCCAAATTCAAACTAGAAACAAACAGATTTTCTCCCTCCTCTCTCATGGCTGCACCAACAGCAGCTACCCCTGCTTCCTTCTCACTTTAAGCTAGTAACCACATCACCAAATCAAGAATTCCCCATTCAACACAAAGGGCAAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000489
ATGGACGCTGCTGCAGATTCCAGGCCCTGGCCGTGCAGGGCCCAACTCCAAGCAGCGATAAAGAGGCAGCAGGCGCCACCTGGAGTCGACACGAGAATCCACTGGGAGAGCGATGATGAAGGATGGATAGGGGGCAGTAGCTCCAGCTCAACAAAGGAGCAGGCCAAAGAGGAAGACAGGTCGCTTGGCGAGAAGTTCTCGGAGCTGCTCAACAGTTCATCTGATTCATATTACCAGTTTCTGGGAGTACCTACGAACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782394.1
MDAAADSRPWPCRAQLQAAIKRQQAPPGVDTRIHWESDDEGWIGGSSSSSTKEQAKEEDRSLGEKFSELLNSSSDSYYQFLGVPTNADMEEIKAAYRRLSKEYHPDTTVLPLRTASEKFMKLREIYNVLSNEEKRKFYDWTLAQEAASREAEKMRIKLDDPYMREVQQYESVPDMVDRLGGRNMELNDQATQALTFDILIIIFSICCLIYVVYFKEPY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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