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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000907`

染色体: Chr08 坐标: 6705849-6707588 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000907`
名称	SmilChr08G000907
描述	uncharacterized SmilChr08G000907
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6705849 - 6707588 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000493`
GeneID	`131000493`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000493`
原始查询	`SmilChr08G000907`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=low
产物	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G31150` (AT1G31150) K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000] identity=28.1; qcov=0.861; evalue=9.86e-14; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000493

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782399.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057782399.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782399.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782399.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782399.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6706215`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B139
`Chr8:6706215`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B139
`Chr8:6706448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B56,B96
`Chr8:6706579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,C84
`Chr8:6706729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr8:6706839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C41
`Chr8:6706898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B26
`Chr8:6706919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:6706931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C28
`Chr8:6707404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B126,B39,B4,C55
`Chr8:6707405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B63
`Chr8:6707412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782399.1

302 aa

151

302

DUF8566

DUF1985

PF29561 DUF8566 82-271 aa PF09331 DUF1985 116-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782399.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	82	271	1.1e-07	32.6	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057782399.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	116	241	8.5e-14	52.4	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926416.1
AACCCCACACAAATCGTAGCCGTGTACTCCATAATAGAGCAAAAACAACTTGGTGAATTATTCTATCTTCTCAATTAACAATGAGTGAAACTGAATCCGACTACTCCAGAGAGGAAGAACAGCCTGTAGAACGAGGCCATCGCCCGAGTACATCGAGGAGGGAAAAATACCCGACGCCGAATCCGCCTCCGAGGCATGCTTGGTTACGTCCGTGCATGCAAGGTTATGCCGGACGAATCAATCACTATGTAAAGGACACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000493
ATGAGTGAAACTGAATCCGACTACTCCAGAGAGGAAGAACAGCCTGTAGAACGAGGCCATCGCCCGAGTACATCGAGGAGGGAAAAATACCCGACGCCGAATCCGCCTCCGAGGCATGCTTGGTTACGTCCGTGCATGCAAGGTTATGCCGGACGAATCAATCACTATGTAAAGGACACGACACTGAAGGAAGTGGAGACCTGTCTGACGCACTACCAGCGTTTAGAACAATTTAAGAAAGGTCCGTTTGGGCATTTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782399.1
MSETESDYSREEEQPVERGHRPSTSRREKYPTPNPPPRHAWLRPCMQGYAGRINHYVKDTTLKEVETCLTHYQRLEQFKKGPFGHLLQLKRQDSANAALHHLLARELYDKAFGPWEKWFHVGGHDIRFGAVEYCLVTGLCFGPSPQRFDPNVDHRVGKQSLWHGVLKGKKVEVKDLRKRFVNRSLGNSAQDYLKAANILVAYDLLFCRDYKYVHDWVWALVEEDQKWSDFPWGSYSFQIFCHGMSVLKKHPNEITGNRKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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