当前解析结果
SmilChr08G000933| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000933 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000933 |
| 描述 | nodulin homeobox-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 6918206 - 6924295 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000562 |
|---|---|
| GeneID | 131000562 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000562 |
| 原始查询 | SmilChr08G000933 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | nodulin homeobox-like |
| 产物 | nodulin homeobox-like |
| Arabidopsis | AT4G03090 (AT4G03090)sequence-specific DNA binding transcription factor ATNDX [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828094] identity=43.5; qcov=1.02; evalue=1.14e-124; confidence=medium |
| Rice | Os05g0188600- identity=36.9; qcov=0.307; evalue=1.57e-21; confidence=low |
| GO | GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0009908 (flower development) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF25246 (Nodulin_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000562 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057782537.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057782537.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057782537.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057782537.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782537.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057782537.1PF25246
Nodulin_N 25-427 aa
PF25246
Nodulin_N 428-507 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057782537.1 |
Pfam | PF25246 |
Nodulin_N | Domain | 25 | 427 | 7.2e-202 | 672.1 | Nodulin N-terminal domain |
XP_057782537.1 |
Pfam | PF25246 |
Nodulin_N | Domain | 428 | 507 | 7.2e-202 | 672.1 | Nodulin N-terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。