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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000934`

染色体: Chr08 坐标: 6927682-6936138 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000934`
名称	SmilChr08G000934
描述	sister-chromatid cohesion protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	6927682 - 6936138 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000518`
GeneID	`131000518`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000518`
原始查询	`SmilChr08G000934`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sister-chromatid cohesion protein 3-like
产物	sister-chromatid cohesion protein 3-like
Arabidopsis	`AT2G47980` (SCC3) sister-chromatid cohesion protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819410] identity=62.8; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0188500` - identity=58.1; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000785 (chromatin); GO:0003682 (chromatin binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0007062 (sister chromatid cohesion); GO:0008278 (cohesin complex)
KEGG	-
Pfam	PF08514 (STAG); PF21581 (SCD); PF24571 (HEAT_SCC3-SA); PF31007 (STAG_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000518

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782453.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057782453.1`
3	Centromere	着丝粒	0.40000	`XP_057782453.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782453.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782453.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:6935116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782453.1

1132 aa

566

1132

STAG

SCD

HEAT_SCC3-SA

STAG_C

PF08514 STAG 156-259 aa PF21581 SCD 288-361 aa PF24571 HEAT_SCC3-SA 467-720 aa PF31007 STAG_C 891-1022 aa

XP_057782454.1

1130 aa

565

1130

STAG

SCD

HEAT_SCC3-SA

STAG_C

PF08514 STAG 156-259 aa PF21581 SCD 288-361 aa PF24571 HEAT_SCC3-SA 467-720 aa PF31007 STAG_C 891-1022 aa

XP_057782455.1

1025 aa

512

1025

STAG

SCD

HEAT_SCC3-SA

STAG_C

PF08514 STAG 49-152 aa PF21581 SCD 181-254 aa PF24571 HEAT_SCC3-SA 360-613 aa PF31007 STAG_C 784-915 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782453.1`	Pfam	`PF08514`	STAG	Repeat	156	259	1.1e-24	87.2	STAG domain
`XP_057782453.1`	Pfam	`PF21581`	SCD	Repeat	288	361	6.5e-28	97.5	Stromalin conservative domain
`XP_057782453.1`	Pfam	`PF24571`	HEAT_SCC3-SA	Repeat	467	720	1.4e-77	262.0	Cohesin subunit SCC3/SA, HEAT-repeats domain
`XP_057782453.1`	Pfam	`PF31007`	STAG_C	Domain	891	1022	1.8e-35	122.1	STAG protein C-terminal domain
`XP_057782454.1`	Pfam	`PF08514`	STAG	Repeat	156	259	1.1e-24	87.2	STAG domain
`XP_057782454.1`	Pfam	`PF21581`	SCD	Repeat	288	361	6.5e-28	97.5	Stromalin conservative domain
`XP_057782454.1`	Pfam	`PF24571`	HEAT_SCC3-SA	Repeat	467	720	1.4e-77	262.0	Cohesin subunit SCC3/SA, HEAT-repeats domain
`XP_057782454.1`	Pfam	`PF31007`	STAG_C	Domain	891	1022	1.8e-35	122.1	STAG protein C-terminal domain
`XP_057782455.1`	Pfam	`PF08514`	STAG	Repeat	49	152	1.1e-24	87.2	STAG domain
`XP_057782455.1`	Pfam	`PF21581`	SCD	Repeat	181	254	5.7e-28	97.7	Stromalin conservative domain
`XP_057782455.1`	Pfam	`PF24571`	HEAT_SCC3-SA	Repeat	360	613	1.1e-77	262.2	Cohesin subunit SCC3/SA, HEAT-repeats domain
`XP_057782455.1`	Pfam	`PF31007`	STAG_C	Domain	784	915	1.6e-35	122.3	STAG protein C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926470.1
AAATGCAACAAAATGGGTGAAAGGGAAGAGAAAAACTTTGACTTGATAGTAAACCATTTTGGGTTCCCGCTCCAGTCTTCGATTACTTCCACTACTATATTCAACTGGCGGGAAGATTTAATCACTTATTCGGAGCTAATCGCTCTATTCTTCAACGCCCTCATCTCTCTCTCTCTCTCTACACTCTGGCATACCATAATCCGTGACATTTGATTAACAGTGAATTAGATTTACAGTTAATTCATGGAAGAGGAACCAGT...

XM_057926471.1
AAATGCAACAAAATGGGTGAAAGGGAAGAGAAAAACTTTGACTTGATAGTAAACCATTTTGGGTTCCCGCTCCAGTCTTCGATTACTTCCACTACTATATTCAACTGGCGGGAAGATTTAATCACTTATTCGGAGCTAATCGCTCTATTCTTCAACGCCCTCATCTCTCTCTCTCTCTCTACACTCTGGCATACCATAATCCGTGACATTTGATTAACAGTGAATTAGATTTACAGTTAATTCATGGAAGAGGAACCAGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131000518
ATGGAAGAGGAACCAGTTGCGCCGGATACAGCTACTCGCCGTTCGAAAAGACCTAGGGCTGAGGTCAAGCAAGCCGATTTCACTCGCACAGACAGAATTGAAGATTTATTGGAAGAAGAGAGGGAAGAATCTTCGGATGAATTTCAACAACCTCGCCCCAAAGCTAAGAGAAATAGAGCTAATGAAGGTGCTTCAACTTCGGCTGCAGCCGCTCGTAAAGCCGACCACACTTTGATTGAGGTTATTAAAGGTGATGGGAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057782453.1
MEEEPVAPDTATRRSKRPRAEVKQADFTRTDRIEDLLEEEREESSDEFQQPRPKAKRNRANEGASTSAAAARKADHTLIEVIKGDGKEIPEVVKRWVEHYERNQKSAMAELLTMLFEACGAKYSILEENIDETDVDDVVVALVNMAKRGEVEDYQSSKRGFKHLKDNLVYFWDNLVSECQNGPLFDQSLFDRCLDYIIALSCTPPRSYRQIASLMGLQLVTSFINVAKILGPQRATTQRQLDAENKKKIDGPRVESLTKR...

XP_057782454.1
MEEEPVAPDTATRRSKRPRAEVKQADFTRTDRIEDLLEEEREESSDEFQQPRPKAKRNRANEGASTSAAAARKADHTLIEVIKGDGKEIPEVVKRWVEHYERNQKSAMAELLTMLFEACGAKYSILEENIDETDVDDVVVALVNMAKRGEVEDYQSSKRGFKHLKDNLVYFWDNLVSECQNGPLFDQSLFDRCLDYIIALSCTPPRSYRQIASLMGLQLVTSFINVAKILGPQRATTQRQLDAENKKKIDGPRVESLTKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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