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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000943`

染色体: Chr08 坐标: 7019638-7025769 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000943`
名称	SmilChr08G000943
描述	autophagy-related protein 18g
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7019638 - 7025769 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000526`
GeneID	`131000526`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000526`
原始查询	`SmilChr08G000943`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	autophagy-related protein 18g
产物	autophagy-related protein 18g
Arabidopsis	`AT1G03380` (ATG18G) autophagy 18 G-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838702] identity=52.1; qcov=0.874; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0405900` (OsATG18f) - identity=52.4; qcov=0.818; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006914 (autophagy); GO:0042594 (response to starvation)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF12490 (BCAS3); PF21034 (BCAS3_WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000526

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782467.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057782467.1`
3	Endosome	内体	0.20000	`XP_057782467.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782467.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782467.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7020349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:7020367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B63,B88,C16,D2
`Chr8:7020585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C8,D11
`Chr8:7022399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:7022912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,C8,D11,D7
`Chr8:7023065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,C8,D11,D7
`Chr8:7023199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C19,C81
`Chr8:7023664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B22,B47,B91,C52
`Chr8:7024405`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C19
`Chr8:7024405`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C19
`Chr8:7024408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B8,C27,C84
`Chr8:7024472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782467.1

955 aa

478

955

BCAS3_WD40

WD40

BCAS3

PF21034 BCAS3_WD40 46-468 aa PF00400 WD40 359-387 aa PF12490 BCAS3 603-742 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782467.1`	Pfam	`PF21034`	BCAS3_WD40	Repeat	46	468	3.7e-62	211.2	BCAS3, WD40 repeat
`XP_057782467.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	359	387	3.2e-07	31.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057782467.1`	Pfam	`PF12490`	BCAS3	Domain	603	742	1.4e-39	136.3	BCAS3 microtubule associated cell migration factor, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926484.1
GCACACACACACACAACACGCATATATATAATCGAACCGAGTCCATACACAGTAAACACAGGCATTTTTCGCTTCAAGTCAAACCCCACAAATTTCACCAAAAAATTTACGAAATCGTCTCATAATTATTGCTGCTGTTTCGCGTGGTGTCCTCATTTCTCTCCGGCGATCGTAGAAATTGATGATCGACGGCAGCTCGGCTGACGCGTCGGCCTGTGCGGCGGTGCGCGACGGCGGTGGACTGGATTCCGACCTCTGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000526
ATGAAGAAAGGCAAGGGGAAGACCAGCAAATTGCTGCCTAATTCTTTGAGGATTATATCGTCTTGTATCAAAACGGTGTCGACGAATGCTAGCACCGCCGTGCGCTCCGCCGGTGCGTCCGTTGCTTCCTCCATTTCCTCCCCTGGAGACGATCGGAAGGAGCAGGTTTTGTGGGCTGGCTTTGACAAATTAGAGCTCAGTGCAACTTCCGTCAGATGTGTCCTATTACTTGGCTATCTGAAAGGTTTTCAGGTCTTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782467.1
MKKGKGKTSKLLPNSLRIISSCIKTVSTNASTAVRSAGASVASSISSPGDDRKEQVLWAGFDKLELSATSVRCVLLLGYLKGFQVFDVEDASGLSELVSRRDGPVTFLQMLPAPANCNGTGKYKSSHPLLVVVGGNEDERIPSVQYTGQSNGRYGLTETSFGCPIEPPTAVRFYSMKSNEYVKVIDFKSAVFMVRCSPRVVAIGLEEQIYCFDTLTLEKKFIVITYPVPRVGEQGSFGINTGYGPMALGSRWLAYPPNRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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