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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000946`

染色体: Chr08 坐标: 7056896-7059686 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000946`
名称	SmilChr08G000946
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RKF3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7056896 - 7059686 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000549`
GeneID	`131000549`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000549`
原始查询	`SmilChr08G000946`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RKF3
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RKF3
Arabidopsis	`AT2G48010` (RKF3) receptor-like kinase in in flowers 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819413] identity=63.4; qcov=0.939; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0384300` (OSJNBb0093M23.7) - identity=54.5; qcov=0.944; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF19160 (SPARK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000549

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057782508.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782508.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782508.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782508.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782508.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7057190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:7057290`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B112
`Chr8:7057290`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B112
`Chr8:7057555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr8:7057577`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A22,B118,B79,B86,C52,C55,C61,C8,C87
`Chr8:7057650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:7057733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:7057742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,C10,C72,D10
`Chr8:7057848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:7058002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr8:7058024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:7058108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B129,B131,B79,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782508.1

643 aa

322

643

SPARK

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF19160 SPARK 38-191 aa PF00069 Pkinase 307-513 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 309-580 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782508.1`	Pfam	`PF19160`	SPARK	Domain	38	191	2.4e-38	132.8	SPARK
`XP_057782508.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	307	513	1e-38	134.0	Protein kinase domain
`XP_057782508.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	309	580	2.7e-39	135.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926525.1
CATAGAGTAGTAAAAGTGCGTAGAAGGTTCCGATGTGTATTTATGGTAGCGGAGTTGTAGAGCCTCCTTCCTCCGAAGCTTCTCTCTCTTTCTCTGCAACTAGTCATCGTTGCTGGCCGCCGCCTGCAAATGAAACTGAGCTCACCTCCATTTTATCTCCCATCACACGAAAACCTCACCTCGGAACACACACTAACAACTGCAGAACTCACTGATACCTCTACTTCCCCAATTTTAGATGCTTCGCTTAATTTATTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000549
ATGCTTCGCTTAATTTATTTTCTACTATCAATTTCCCAATTACTAATAATTCCATCGGCGTCCTTCGCCGGCCACCGTGGCCCCCGCCGGAACCTACTCCAGAACGGCTCCGATTCCTCCCGATGCCCGCTCAACTTCGAACCCCTGCGGGGGCTGGCGCCGAACTCCCAGCGCCCTAATCTGGACACCCACTCCGAGTGCCAGTACATCCTGCAAGGCCTCCGCCTCGTCCTCGCCGACCACCTCCGCCTCACCAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782508.1
MLRLIYFLLSISQLLIIPSASFAGHRGPRRNLLQNGSDSSRCPLNFEPLRGLAPNSQRPNLDTHSECQYILQGLRLVLADHLRLTNSFLPPLDSAESCWEIYESLVREYVPGFDIRRSCGFETPWIARGCMNITTRSEFEAQVPRSALDGVDTACNQSLLNNSPCASCTTSLAGIRASYLQGPSVGNVSDCTAYPFIYAAAFANQFGPADVGTTKCLFNLDFTSSHSNSKRKKIVISVVVVACVVILVLGFAVFWFLRRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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