当前解析结果
SmilChr08G000948| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000948 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000948 |
| 描述 | sugar transporter ERD6-like 7 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 7062767 - 7064601 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000610 |
|---|---|
| GeneID | 131000610 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000610 |
| 原始查询 | SmilChr08G000948 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | sugar transporter ERD6-like 7 |
| 产物 | sugar transporter ERD6-like 7 |
| Arabidopsis | AT2G48020 (AT2G48020)Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819414] identity=69.2; qcov=0.99; evalue=2.18e-97; confidence=high |
| Rice | Os11g0643800- identity=59.7; qcov=1; evalue=1.04e-82; confidence=high |
| GO | GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00083 (Sugar_tr) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000610 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057782606.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057782606.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782606.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057782606.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057782606.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057782606.1PF00083
Sugar_tr 1-195 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057782606.1 |
Pfam | PF00083 |
Sugar_tr | Family | 1 | 195 | 7.8e-46 | 157.6 | Sugar (and other) transporter |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。