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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000956`

染色体: Chr08 坐标: 7115245-7120527 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000956`
名称	SmilChr08G000956
描述	RNA demethylase ALKBH10B-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7115245 - 7120527 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000560`
GeneID	`131000560`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000560`
原始查询	`SmilChr08G000956`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA demethylase ALKBH10B-like
产物	RNA demethylase ALKBH10B-like
Arabidopsis	`AT4G02940` (AT4G02940) oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828132] identity=54.7; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0116900` (OSJNBa0023I19.11) - identity=30; qcov=0.978; evalue=4.11e-65; confidence=low
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0006402 (mRNA catabolic process); GO:0032451 (demethylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF27981 (ALKBH10B_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000560

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782535.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782535.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782535.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782535.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7115561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B101
`Chr8:7115579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,B98,C45
`Chr8:7115824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C75
`Chr8:7116155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:7117234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:7119819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:7119889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:7120075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr8:7120125`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C80
`Chr8:7120125`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C80
`Chr8:7120126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782535.1

535 aa

268

535

ALKBH10B_N

PF27981 ALKBH10B_N 44-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782535.1`	Pfam	`PF27981`	ALKBH10B_N	Domain	44	126	4.8e-40	136.6	RNA demethylase ALKBH10B N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926552.1
CGGACATTTCCACCTAAACCTCCCACGCCCCAAACCCTCGCTTTCATCACCACCTTTTCCTATCAACCTTTTTTCCGCTCTCTACAAATTCTAGACGAATACATTCCGCTCAGTTAAATTTCTAGAAAGAAAAATTGCATACAGAAACACAGCGCCCAGACGCAACGATCAAAATTTGATACTGACATATACCGATTCAGAGCAATCCAGATTTCGGTAGCGGAAAAAGTGTGTTCTATTAGTGCTGTTTTTCACCTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000560
ATGCCGCCGGCGGCGGGCGTAGCAGCAGCAGTGCAGGGCGATCGGGCGGCCTTGAAAACGATGGTGGTTCCGGCAGTGATGCAGCAGCCTCAGCTGCCGATGATGACGGCGGCATCGGAGGTGTTCGCCAAGGACGCCATTATCGCCTGGTTCCGCGGCGAATTTGCTGCGGCGAACGCGATTATTGATGCGCTGTGCAGCCACCTGACGCAGCTGGAGGACGGCACCGCGGCGGCCGCATACGAATCGGCTTTCGCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782535.1
MPPAAGVAAAVQGDRAALKTMVVPAVMQQPQLPMMTAASEVFAKDAIIAWFRGEFAAANAIIDALCSHLTQLEDGTAAAAYESAFAAIHRRRLNWIPILQMQKYFSIADVTVELKKVVEKKRSENDVEMKKAEEVADGGCTAAIDEKEKQKDNNQESSLVSNENGGGEVVDEDFSSEITDTGSQEVQPFSEPVEICSNHEKCEARRAQIKMTKGFVAKEPVKGHMVNVVRGLKLYEDIFTETELSKLNDFVNELRVAGQN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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