当前解析结果
SmilChr08G000957| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000957 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000957 |
| 描述 | ACT domain-containing protein ACR10-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 7144286 - 7145564 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131000614 |
|---|---|
| GeneID | 131000614 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000614 |
| 原始查询 | SmilChr08G000957 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ACT domain-containing protein ACR10-like |
| 产物 | ACT domain-containing protein ACR10-like |
| Arabidopsis | AT2G36840 (ACR10)ACT-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818257] identity=67.1; qcov=0.845; evalue=9.66e-70; confidence=high |
| Rice | Os09g0570900 (B1331F11.3-1)- identity=54.3; qcov=0.866; evalue=1.01e-54; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF24914 (ACR10_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000614 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057782609.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057782609.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057782609.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057782609.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057782609.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:7144401 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B42,B43,B53 |
Chr8:7144477 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B33,C32 |
Chr8:7144477 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B33,C32 |
Chr8:7144771 |
ATG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 3 | A23,B118,B36 |
Chr8:7144771 |
ATG |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | A23,B118,B36 |
Chr8:7145380 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,B28,B55,C32,C68 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057782609.1PF24914
ACR10_N 11-86 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057782609.1 |
Pfam | PF24914 |
ACR10_N | Domain | 11 | 86 | 1.1e-41 | 140.8 | ACT domain-containing protein ACR10, N-terminal |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。