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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000962`

染色体: Chr08 坐标: 7160153-7162698 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000962`
名称	SmilChr08G000962
描述	alpha-L-fucosidase 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7160153 - 7162698 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000561`
GeneID	`131000561`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000561`
原始查询	`SmilChr08G000962`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-L-fucosidase 1
产物	alpha-L-fucosidase 1
Arabidopsis	`AT2G28100` (FUC1) alpha-L-fucosidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817355] identity=69; qcov=0.808; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0560400` - identity=60.8; qcov=0.824; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004560 (alpha-L-fucosidase activity); GO:0005764 (lysosome); GO:0006004 (fucose metabolic process); GO:0016139 (glycoside catabolic process)
KEGG	smil00511 (Other glycan degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01120 (Alpha_L_fucos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000561

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057782536.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057782536.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057782536.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782536.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782536.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7160444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr8:7160634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B31,C81
`Chr8:7160727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B68
`Chr8:7160764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C29,C4
`Chr8:7160834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:7160933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C29
`Chr8:7160947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:7162551`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B1
`Chr8:7162551`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782536.1

563 aa

282

563

Alpha_L_fucos

PF01120 Alpha_L_fucos 126-389 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782536.1`	Pfam	`PF01120`	Alpha_L_fucos	Domain	126	389	2.5e-32	113.4	Alpha-L-fucosidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926553.1
AAGGACTTATATGACGTAAAATAACCGCATTGAAATCGAATTGTTCAAGTTAGGATAAACAAAACATTAGAATCAAGAAAGAGAAAGGAAGCATATAGTTGAGGGAAAAAAATGAATGCTTCTCAAATTTCATAATTCCCTTGACAGTCAGTTAAATATAAGTCAAAACTACCTCCCAGCCATTGAAGAAAGCAAAAACATGATCACCACCAACAAACGAGCTCTCAGTCAACAGCAATCTCCACGACCCTCCAAGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000561
ATGCTTCTCAAATTTCATAATTCCCTTGACAGTCAGTTAAATATAAGTCAAAACTACCTCCCAGCCATTGAAGAAAGCAAAAACATGATCACCACCAACAAACGAGCTCTCAGTCAACAGCAATCTCCACGACCCTCCAAGAAAAATCTCAAATTTCCGCAGCCCAGTTGGGCAAAACGAATTCCCATCATCTTCACAGTCACGATCGTCCATCTTCTCCAAGTTACGAGCTCAGTTTCACCGCCGCCGCTGCCGATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782536.1
MLLKFHNSLDSQLNISQNYLPAIEESKNMITTNKRALSQQQSPRPSKKNLKFPQPSWAKRIPIIFTVTIVHLLQVTSSVSPPPLPILPIPTAQQISWQLAEMALFFHFGTNTFTDSEWGTGHADPSVFNPTELNATQWVNVAKESGFSRVILTVKHHDGFCLWPSDYTDYSVKSSSWRNGSGDVVRDLAEAARIGGVQLGVYLSPWDMHEPCYGNTLEYNEFYLGQMTELLTRYGEIKEVWLDGAKGHGAKDMDYFFDDW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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