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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000976`

染色体: Chr08 坐标: 7287712-7292063 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000976`
名称	SmilChr08G000976
描述	SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7287712 - 7292063 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000617`
GeneID	`131000617`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000617`
原始查询	`SmilChr08G000976`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-3
产物	SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-3
Arabidopsis	`AT2G28060` (AT2G28060) 5'-AMP-activated protein kinase beta-2 subunit protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817350] identity=58.9; qcov=1; evalue=1.26e-42; confidence=medium
Rice	`Os09g0364900` (OJ1001_G09.33-1) - identity=64.3; qcov=1; evalue=5.93e-46; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF04739 (AMPKBI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000617

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782613.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782612.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782612.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782612.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782612.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7288299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B119,B26,B28,B85
`Chr8:7291794`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A9,B101,B102,B11,B118,B123,B128,B130,B135,B26,B30,B36,B64,B70,B74,B78,C1,C34,C56,C73,C83,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782612.1

152 aa

152

AMPKBI

PF04739 AMPKBI 79-148 aa

XP_057782613.1

112 aa

112

AMPKBI

PF04739 AMPKBI 39-108 aa

XP_057782614.1

112 aa

112

AMPKBI

PF04739 AMPKBI 39-108 aa

XP_057782615.1

112 aa

112

AMPKBI

PF04739 AMPKBI 39-108 aa

XP_057782616.1

112 aa

112

AMPKBI

PF04739 AMPKBI 39-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782612.1`	Pfam	`PF04739`	AMPKBI	Family	79	148	9e-25	87.2	5'-AMP-activated protein kinase beta subunit, interaction domain
`XP_057782613.1`	Pfam	`PF04739`	AMPKBI	Family	39	108	7.7e-25	87.4	5'-AMP-activated protein kinase beta subunit, interaction domain
`XP_057782614.1`	Pfam	`PF04739`	AMPKBI	Family	39	108	7.7e-25	87.4	5'-AMP-activated protein kinase beta subunit, interaction domain
`XP_057782615.1`	Pfam	`PF04739`	AMPKBI	Family	39	108	7.7e-25	87.4	5'-AMP-activated protein kinase beta subunit, interaction domain
`XP_057782616.1`	Pfam	`PF04739`	AMPKBI	Family	39	108	7.7e-25	87.4	5'-AMP-activated protein kinase beta subunit, interaction domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926630.1
AGTTGTAGTGTAATTTGTAAATTGTAATTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCCTTGCATCTCTCTCACACGCACGCACGCAAAGAGACGAGACACGCAGAGAGACATGATTCTTTGAGAATCTGTCGTCGGATTCTACTAGGCTTCTTTGTTCCAGCAACAATGAACCACCAATATGGTGAAGACCAAGATCGAGTGAGTGTAGTTGGATTCGACGTCCCCAACTCCCCCGAAGCAAGTTACAACAATG...

XM_057926629.1
ATTCAGAAATAAATAAAAAGTTGATGCGTATATCTTCTTTCTCGCGTTCTCTTTTCGTAAATTGTCATGAATTATTGGGTTTTTTAATTTCTTTGCCACTCTTTTACCTGAACCATAACTCAGGCTTCTTTGTTCCAGCAACAATGAACCACCAATATGGTGAAGACCAAGATCGAGTGAGTGTAGTTGGATTCGACGTCCCCAACTCCCCCGAAGCAAGTTACAACAATGCCTACCCTGGAAATGAAGACGAGGGGCGA...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131000617
ATGCGTATATCTTCTTTCTCGCGTTCTCTTTTCGTAAATTGTCATGAATTATTGGGTTTTTTAATTTCTTTGCCACTCTTTTACCTGAACCATAACTCAGGCTTCTTTGTTCCAGCAACAATGAACCACCAATATGGTGAAGACCAAGATCGAGTGAGTGTAGTTGGATTCGACGTCCCCAACTCCCCCGAAGCAAGTTACAACAATGCCTACCCTGGAAATGAAGACGAGGGGCGAGAACCACCATCACTACCTCCCCA...

LOC131000617
ATGAACCACCAATATGGTGAAGACCAAGATCGAGTGAGTGTAGTTGGATTCGACGTCCCCAACTCCCCCGAAGCAAGTTACAACAATGCCTACCCTGGAAATGAAGACGAGGGGCGAGAACCACCATCACTACCTCCCCATCTGCAGCATACTTTGTTGAATCACCTGACGACGAGTGATCCTTGTGCACCCCTTCCATCACCGCAAAATGTTACACTAAATCATCTTTACATAGAGAATAGAGAACCTCCTCGCACAAT...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057782612.1
MRISSFSRSLFVNCHELLGFLISLPLFYLNHNSGFFVPATMNHQYGEDQDRVSVVGFDVPNSPEASYNNAYPGNEDEGREPPSLPPHLQHTLLNHLTTSDPCAPLPSPQNVTLNHLYIENREPPRTIVALGVTHRFRSKFVTVVLYKPVPRR

XP_057782613.1
MNHQYGEDQDRVSVVGFDVPNSPEASYNNAYPGNEDEGREPPSLPPHLQHTLLNHLTTSDPCAPLPSPQNVTLNHLYIENREPPRTIVALGVTHRFRSKFVTVVLYKPVPRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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