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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000977`

染色体: Chr08 坐标: 7326749-7332503 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000977`
名称	SmilChr08G000977
描述	P-loop NTPase domain-containing protein LPA1 homolog 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7326749 - 7332503 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000541`
GeneID	`131000541`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000541`
原始查询	`SmilChr08G000977`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P-loop NTPase domain-containing protein LPA1 homolog 1-like
产物	P-loop NTPase domain-containing protein LPA1 homolog 1-like
Arabidopsis	`AT5G60760` (AT5G60760) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836197] identity=60; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0819400` (LPA1) - identity=59.7; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28345 (LPA1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000541

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782498.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057782498.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782498.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782498.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782498.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7327180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:7327226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr8:7327278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A3,C58
`Chr8:7327453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,C63,C67
`Chr8:7327662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:7328555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:7329528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,C11,C69,C77
`Chr8:7330298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B8,C27,C84
`Chr8:7331099`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B123,B14,B44,D10
`Chr8:7331099`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B123,B14,B44,D10
`Chr8:7331212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:7331316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782498.1

718 aa

359

718

LPA1_N

PF28345 LPA1_N 14-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782498.1`	Pfam	`PF28345`	LPA1_N	Domain	14	164	1.5e-50	171.7	P-loop NTPase domain-containing protein LPA1 N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926515.1
TCAGAAACCGCCTCCTTTTCTTTCTCTTCTCGCTCTAAGTGCCTGCATGGGGGTAGAATAGGGCTGGAGGATGTCGGTGCCGGATGGATTGGCCACCAAGCTTCTCTACGTAGTGGTGCTGGACGATGACGATGATGCGGAGGCTCCCTCCTTTCGGTACTCGCGTTCGGTTCTCCAGAGTACTCTGCAGCTCATTGGCTGCAAGCCTCGCCATTCCTTCAAGATCAGCCAAAGGGTATTTGAGGTGATAAAGCGGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000541
ATGTCGGTGCCGGATGGATTGGCCACCAAGCTTCTCTACGTAGTGGTGCTGGACGATGACGATGATGCGGAGGCTCCCTCCTTTCGGTACTCGCGTTCGGTTCTCCAGAGTACTCTGCAGCTCATTGGCTGCAAGCCTCGCCATTCCTTCAAGATCAGCCAAAGGGTATTTGAGGTGATAAAGCGGGAAAATGCTCTGGAGAGGTTCGTTTCCCCTTTTGTTGGGGCGTTAGCTCAAGATGTCAAAGCATATCACAACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782498.1
MSVPDGLATKLLYVVVLDDDDDAEAPSFRYSRSVLQSTLQLIGCKPRHSFKISQRVFEVIKRENALERFVSPFVGALAQDVKAYHNRETESHVDACLEKADVVNSALEEDKSKEEPFELYKRRTTLVVRRKFFLDTVCEALSEYKYVGPNQRADLVIACRVRERKESVTVLLCGTSGCGKSTLSALLGSRLGITTIVSTDSIRHMMRSFVDEKENPLLWASTYHAGEHLDPLAVAQAKAKKKAKKSSHVSTASHDAFSND...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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