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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000981`

染色体: Chr08 坐标: 7355657-7359385 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000981`
名称	SmilChr08G000981
描述	OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 12-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7355657 - 7359385 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000582`
GeneID	`131000582`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000582`
原始查询	`SmilChr08G000981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 12-like
产物	OVARIAN TUMOR DOMAIN-containing deubiquitinating enzyme 12-like
Arabidopsis	`AT5G04250` (AT5G04250) Cysteine proteinases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830304] identity=47.7; qcov=1; evalue=1.2e-100; confidence=high
Rice	`Os03g0859800` - identity=66.8; qcov=0.615; evalue=6.9e-102; confidence=high
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF02338 (OTU)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000582

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782569.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782569.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782570.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782569.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782569.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7355769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A11,A3,B138,B25,B31,B35,B42,B43,B7,B71,B88,B94,B98,C1,C15,C41,C45,C58,C61,C82,C85,D7
`Chr8:7355789`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B58,B72,C29,C31
`Chr8:7355789`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B58,B72,C29,C31
`Chr8:7355824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr8:7356097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,D10
`Chr8:7356665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr8:7356830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,D3
`Chr8:7358115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B125,B99,C69,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782569.1

386 aa

193

386

OTU

PF02338 OTU 206-299 aa

XP_057782570.1

353 aa

176

353

OTU

PF02338 OTU 206-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782569.1`	Pfam	`PF02338`	OTU	Domain	206	299	8e-13	49.7	OTU-like cysteine protease
`XP_057782570.1`	Pfam	`PF02338`	OTU	Domain	206	299	2.8e-11	44.7	OTU-like cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926586.1
AACGGGAAAACGGACAAACGTAAAAGAATCGCCGTCAGTTTGATAACAACAGCTTCTGAATACACTGGGAATTGAGACCCCAAAACTGAGATTCCAATTCCATTGTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGACAGCAATTCAATTCACCTCGTGACATGACACCCCACCCCCCGAAATTCACGACATTTTCTCACTCACCCGAATCAATCCCATTATTTCCACACCTTAAATACTCATCATCAATTCTTCCTCTCCTCTC...

XM_057926587.1
ACGGACAAACGTAAAAGAATCGCCGTCAGTTTGATAACAACAGCTTCTGAATACACTGGGAATTGAGACCCCAAAACTGAGATTCCAATTCCATTGTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGACAGCAATTCAATTCACCTCGTGACATGACACCCCACCCCCCGAAATTCACGACATTTTCTCACTCACCCGAATCAATCCCATTATTTCCACACCTTAAATACTCATCATCAATTCTTCCTCTCCTCTCTCTCAATTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000582
ATGATCACATACGACCAAGATCCTGATGTTATTCGCTGGGGACTTAAGCTCTTTGATGGTGATCCTTATTCTAATTGTGGATATTGTGGTTCCATCCCCCAACATAACGCGGACTGCTATCCGGGGCATTATTTGAAAGGATATCAGTATGAGTCGGACTGCAATTATGCAGGAGACCAAAACCTTAATGTAGACAGCCTTCACGACGAACTATCACAACTTTCAGTGACTGAACCAATCAAGTTGTTCCAAGATGGCAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782569.1
MITYDQDPDVIRWGLKLFDGDPYSNCGYCGSIPQHNADCYPGHYLKGYQYESDCNYAGDQNLNVDSLHDELSQLSVTEPIKLFQDGMEHQTSFCSQDWFPHSLGNYSYVVDGHDSQHEEETDLGISASCSSPGDELYCEEEWSNSLELMDEHAFDSEVGKRLNQMASIPHIPKINGEIPSIDEATLDHQRLLDRLLVYELVEFKVQGDGNCQFRALSDQFYRTPEHHKFVREQIVNQLRSFPEIYEGYVPMAYDQYLTKM...

XP_057782570.1
MITYDQDPDVIRWGLKLFDGDPYSNCGYCGSIPQHNADCYPGHYLKGYQYESDCNYAGDQNLNVDSLHDELSQLSVTEPIKLFQDGMEHQTSFCSQDWFPHSLGNYSYVVDGHDSQHEEETDLGISASCSSPGDELYCEEEWSNSLELMDEHAFDSEVGKRLNQMASIPHIPKINGEIPSIDEATLDHQRLLDRLLVYELVEFKVQGDGNCQFRALSDQFYRTPEHHKFVREQIVNQLRSFPEIYEGYVPMAYDQYLTKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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