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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G000999

染色体: Chr08 坐标: 7513914-7520777 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr08G000999
名称SmilChr08G000999
描述receptor-like serine/threonine-protein kinase NCRK
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向7513914 - 7520777 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131000553
GeneID131000553
locus_tag-
NCBI NameLOC131000553
原始查询SmilChr08G000999

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述receptor-like serine/threonine-protein kinase NCRK
产物receptor-like serine/threonine-protein kinase NCRK
ArabidopsisAT2G28250 (NCRK)
Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817371]
identity=51.4; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
RiceOs02g0110600 (P0501G04.13-3)
-
identity=48.5; qcov=0.966; evalue=8.07e-175; confidence=high
GOGO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG-
PfamPF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131000553

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cell membrane 细胞膜 1.00000 XP_057782516.1
2 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057782516.1
3 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057782516.1
4 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057782516.1
5 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057782516.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:7518648 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A11
Chr8:7518793 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D8
Chr8:7519115 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B30
Chr8:7519121 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B112,D3
Chr8:7520214 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B104,B51,B99,C62,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782516.1
623 aa
N
1
312
623
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 230-506 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 233-508 aa
XP_057782517.1
623 aa
N
1
312
623
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 230-506 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 233-508 aa
XP_057782519.1
623 aa
N
1
312
623
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 230-506 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 233-508 aa
XP_057782520.1
623 aa
N
1
312
623
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 230-506 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 233-508 aa
XP_057782521.1
623 aa
N
1
312
623
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 230-506 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 233-508 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057782516.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 230 506 7.1e-43 147.6 Protein kinase domain
XP_057782516.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 233 508 1.2e-41 143.5 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057782517.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 230 506 7.1e-43 147.6 Protein kinase domain
XP_057782517.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 233 508 1.2e-41 143.5 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057782519.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 230 506 7.1e-43 147.6 Protein kinase domain
XP_057782519.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 233 508 1.2e-41 143.5 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057782520.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 230 506 7.1e-43 147.6 Protein kinase domain
XP_057782520.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 233 508 1.2e-41 143.5 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057782521.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 230 506 7.1e-43 147.6 Protein kinase domain
XP_057782521.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 233 508 1.2e-41 143.5 Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA
XM_057926533.1
AGCATTTGAAAAATTCAGGAAGTCTTCAGCCTCGAGAAATCTGAAACGCCACGTGGTTTTAAGCTGGGCTGGGCTTCCTGCATAGACATCTGTGCTCACTCATGCTGTAACCCCTTCACCGTTACAACCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGAGATACCGAGATAGGACACACAGTGAGATACATGTAAGATATTAGTGCAGCCGACTTGCATACACATGGTGTCTAGCTAGCTGTGTTTAAT...
XM_057926534.1
TATGATTGCTGAGGGGTCTCTGTCAGTTCGAGAAGTAGTTGCTTTCACCGAGTTTGGTTGATGAGCCAAATTATACTCATGTACAATATCTTTTCTTCGAACCATGATTTTCTTCTAGCCAAATCCATGTCTTTTTCTTGCATATTTTTTTTTCATTTAATTGTTAGTTGAGATGTCTTTCTATATATGAACAATCTTGGATAAAATACTCCGCTGGTCTGCCCTTGGCTTTCACCTCGTCTTATCATGCGTGAAGTCTG...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA
LOC131000553
ATGGGGCGTCGGGTAGAAATCACACTTCTTTGTTTCATTACCGTGGTCTGGTTTCAGCAGACTCTTTCTGATGGGCCAGCAACAAGTTCTGACACGGACAAGTGGACATGCACTTGTTCTATTGCGCGTGAACAAACCTTGACTTTTGCCCTGGCAAACTGCTCTTCTTCCTGTGATTGTAACCCTGCTGCAGGAGGATCAGATGAAAATAGATGGACTTGCATTTGCAATGCTGGTGGGCTACCTAGGTTAGTAGGTGA...
LOC131000553
ATGGGGCGTCGGGTAGAAATCACACTTCTTTGTTTCATTACCGTGGTCTGGTTTCAGCAGACTCTTTCTGATGGGCCAGCAACAAGTTCTGACACGGACAAGTGGACATGCACTTGTTCTATTGCGCGTGAACAAACCTTGACTTTTGCCCTGGCAAACTGCTCTTCTTCCTGTGATTGTAACCCTGCTGCAGGAGGATCAGATGAAAATAGATGGACTTGCATTTGCAATGCTGGTGGGCTACCTAGGTTAGTAGGTGA...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA
XP_057782516.1
MGRRVEITLLCFITVVWFQQTLSDGPATSSDTDKWTCTCSIAREQTLTFALANCSSSCDCNPAAGGSDENRWTCICNAGGLPRLVGEENGSSCFTACNCNAGTLSELEPSKKRIPVKVVFIVLLLCLVLTAIGLAAIMLWHVYRKDKHPVQWASSSSDRLTSCSSAVNLMSHGSSPMPVYKGYLDSSAKPFMGCIPQNPFLLRRGTKALHGTIIQFSYSELENATDKFSDTNLVGVGGCSHVYRGNLRDGRTVAVKKMKR...
XP_057782517.1
MGRRVEITLLCFITVVWFQQTLSDGPATSSDTDKWTCTCSIAREQTLTFALANCSSSCDCNPAAGGSDENRWTCICNAGGLPRLVGEENGSSCFTACNCNAGTLSELEPSKKRIPVKVVFIVLLLCLVLTAIGLAAIMLWHVYRKDKHPVQWASSSSDRLTSCSSAVNLMSHGSSPMPVYKGYLDSSAKPFMGCIPQNPFLLRRGTKALHGTIIQFSYSELENATDKFSDTNLVGVGGCSHVYRGNLRDGRTVAVKKMKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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