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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001022`

染色体: Chr08 坐标: 7755571-7756456 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001022`
名称	SmilChr08G001022
描述	protein S40-4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7755571 - 7756456 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000615`
GeneID	`131000615`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000615`
原始查询	`SmilChr08G001022`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein S40-4-like
产物	protein S40-4-like
Arabidopsis	`AT5G60680` (AT5G60680) transcription initiation factor TFIID subunit (Protein of unknown function, DUF584) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836189] identity=54.8; qcov=1.03; evalue=4.13e-40; confidence=medium
Rice	`Os04g0520700` (OsS40-13) - identity=44.1; qcov=1.14; evalue=2.78e-31; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04520 (Senescence_reg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000615

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782610.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057782610.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782610.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782610.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782610.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7755934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,C14,C64,C78
`Chr8:7756105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C19
`Chr8:7756241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782610.1

163 aa

163

Senescence_reg

PF04520 Senescence_reg 50-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782610.1`	Pfam	`PF04520`	Senescence_reg	Family	50	163	8.3e-40	138.1	Senescence regulator

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926627.1
GAACCTTATCCGTTCCAACCCTTTATAAAAGCAGATCAAAACCTCCATCTTAAACTATCAAACTTGGCAGAACAAATTCTCTCTCATCATTTCACAGTTCAACAACCACACGCTTATAGAGAGAGGAAATAGTCAGCCCAAACAAATACACACAAAAAAGAGAGAGAGAGAGGATTTATTCATCAGACCTTTCTTTCTGAGTTATATGGCTGCATCCAAAAGCTACTGCGCCAGAGCAAACTACAGATTCCTCCCGAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000615
ATGGCTGCATCCAAAAGCTACTGCGCCAGAGCAAACTACAGATTCCTCCCGAACGATCAGGCTCTCAGTAACGATCCGATGATCTTCGAGCTCGACGAGTCGGACGTCTGGAACGCGGCGGTGCGATCGCAGTCGCCGGAGATTCGCAAGACGAGTAATTCCAGACTCTCACGGAAACCGTCGTCAGTGGCGGGGGGCAACGGACGCGTCGGCGGTCCGTCGTCGCTGCCGGTGAACGTCCCCGACTGGTCGAAGATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782610.1
MAASKSYCARANYRFLPNDQALSNDPMIFELDESDVWNAAVRSQSPEIRKTSNSRLSRKPSSVAGGNGRVGGPSSLPVNVPDWSKILKDEYMDNRRRESDDYYDEDDCEESGDRIPPHEFLARQMARTRISSFSVHEGIGRTLKGRDLSRVRNAIWQKTGFED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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