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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001029`

染色体: Chr08 坐标: 7819790-7821764 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001029`
名称	SmilChr08G001029
描述	lysM domain receptor-like kinase 3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	7819790 - 7821764 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000576`
GeneID	`131000576`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000576`
原始查询	`SmilChr08G001029`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysM domain receptor-like kinase 3
产物	lysM domain receptor-like kinase 3
Arabidopsis	`AT3G57120` (AT3G57120) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824879] identity=52.3; qcov=1.05; evalue=1.31e-152; confidence=high
Rice	`Os02g0819900` (OsRLCK89) - identity=43.2; qcov=0.796; evalue=1.85e-81; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000576

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057782560.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057782560.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782560.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782560.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782560.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:7820774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:7820798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B95
`Chr8:7820843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C65
`Chr8:7821079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:7821091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A3,B104,C58
`Chr8:7821569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782560.1

442 aa

221

442

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 151-409 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 153-411 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782560.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	151	409	1.8e-23	84.0	Protein kinase domain
`XP_057782560.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	153	411	6.2e-27	95.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926577.1
TTGTTAGATAAGTATTAGCATTGCCAAACATAACGAGAAAAAATGGATAGCGTTTTACAAGTCAAAAGCTTTACAGTTGGATGCTTAATAAAAATCCGGGGCGGAATGGTGGTCAAACTTCCCAACAAAGGGTAAATTTATTGTCTTCTTCAACTCCTGTCTTCATCAATGGGCCCCTATAAACTCCATCAAATTATTACTTAATAATCAAAACTTTCATTTAATTATTACTATACCAATTTACTTCGAAGGTTGCAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000576
ATGTGCAGAACGAAAATGGCGATAAGAGCTTCAGACCCGGCCCGAAACCCTAAAGCAGGCTCCAAAACGCCGAGAAGAGGTGTTTCCCAATCGGAGGCGGACAAACCCTCCTCTTCTTCCTCTTTAACGACGTCGAGAGCGCCGCAAACCAACCTCTCCAGTCAATTCCCCCGCGGCGGCTACTCCTCGTCTTCCTCCGCCGGCGGTATCGGCGCTGGTTCATCCTCCTCCTACCTCCTCGATAGCTCCGTCGCCACCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782560.1
MCRTKMAIRASDPARNPKAGSKTPRRGVSQSEADKPSSSSSLTTSRAPQTNLSSQFPRGGYSSSSSAGGIGAGSSSSYLLDSSVATASLSSRTSLSSLRDNLPESTQVYDFSEIRAATNNFLAKRHSSTSSSSQSWRCVLSGKDVVVFQRKLRKSTTSAAVMQKLSVISKGHFTSIVKLVGISISGEHIYLVYEYVQGLDLGLCLRSKIDPNFTVLSTWTSRMQIATDVAYGLDYIHNTAGLSVDMVHKHVKSSGIIVTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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