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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001054`

染色体: Chr08 坐标: 8056083-8063784 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001054`
名称	SmilChr08G001054
描述	uncharacterized SmilChr08G001054
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8056083 - 8063784 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000640`
GeneID	`131000640`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000640`
原始查询	`SmilChr08G001054`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SIT4 phosphatase-associated family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837314]; symbol=AT1G07990; hit=AT1G07990; species=arabidopsis; confidence=high
产物	SIT4 phosphatase-associated family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837314]; symbol=AT1G07990; hit=AT1G07990; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G07990` (AT1G07990) SIT4 phosphatase-associated family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837314] identity=64.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0620400` - identity=64.7; qcov=0.715; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0019888 (protein phosphatase regulator activity); GO:0019903 (protein phosphatase binding); GO:0043666 (GO:0043666)
KEGG	-
Pfam	PF04499 (SAPS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000640

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782629.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057782629.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057782629.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782629.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782629.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8056632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B85
`Chr8:8056658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr8:8060384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr8:8061419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782629.1

847 aa

424

847

SAPS

PF04499 SAPS 131-488 aa

XP_057782630.1

846 aa

423

846

SAPS

PF04499 SAPS 131-488 aa

XP_057782631.1

846 aa

423

846

SAPS

PF04499 SAPS 131-487 aa

XP_057782633.1

845 aa

422

845

SAPS

PF04499 SAPS 131-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782629.1`	Pfam	`PF04499`	SAPS	Family	131	488	2.1e-68	232.0	SIT4 phosphatase-associated protein
`XP_057782630.1`	Pfam	`PF04499`	SAPS	Family	131	488	2.1e-68	232.0	SIT4 phosphatase-associated protein
`XP_057782631.1`	Pfam	`PF04499`	SAPS	Family	131	487	1.8e-68	232.2	SIT4 phosphatase-associated protein
`XP_057782633.1`	Pfam	`PF04499`	SAPS	Family	131	487	1.8e-68	232.2	SIT4 phosphatase-associated protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926646.1
TCGTCGGCTTCTGTTTCCAATTTATACCTTCACCCAATTAATAAATGAAGAAAATAACTGAAAAAATTGAAAGAAAAATAAAAAGTCTGTAGCCGCGCTCGATCTTTGCGGCTCTTTCGATCTTCGAAGGATTAGGGTTTTCAATCTCCACTGCTCATCTTTTGCCCCAATTTCTCCCGCATCCCTCGTTTAAAATTTGAGCTAAATCCTCAAATTTCATGCCTGGATTCGATTTTTGAGCTCACAGATCTACTCAGCTC...

XM_057926648.1
CGTCGGCTTCTGTTTCCAATTTATACCTTCACCCAATTAATAAATGAAGAAAATAACTGAAAAAATTGAAAGAAAAATAAAAAGTCTGTAGCCGCGCTCGATCTTTGCGGCTCTTTCGATCTTCGAAGGATTAGGGTTTTCAATCTCCACTGCTCATCTTTTGCCCCAATTTCTCCCGCATCCCTCGTTTAAAATTTGAGCTAAATCCTCAAATTTCATGCCTGGATTCGATTTTTGAGCTCACAGATCTACTCAGCTCG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131000640
ATGTTCTGGAAGCTCACTGCTATGTCCGCCTCATCTCCTGTTGAGGCTGTGCTGGATAAGGAAAATTTTACTTTGGAAGAACTTTTGGATGAAGAAGAGATAATCCAAGAATGCAAAGCATTGAATAGCCGTCTTATTAATTTTTTGAGGGATAGGGCTCAGGTGGAGCAGCTACTGCACTATATTGTTGAGGAGCCTCCTGAAGATGCAGATAGCAAACGAACTTTTAAGTTTCCTTTCATTGCCTGTGAAATTTTTAC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057782629.1
MFWKLTAMSASSPVEAVLDKENFTLEELLDEEEIIQECKALNSRLINFLRDRAQVEQLLHYIVEEPPEDADSKRTFKFPFIACEIFTCEIDVILKTLVDEEELMNLLFSFLEPDRYHSALLAGYFSKVVVCLMLRKTVPLMNYVKAHQDVFRQLVDLIGITSIMEVLVRLVGGDDHLYPNSLDVMQWLADSNLLEMIVDKLNDSNPPEVHANAAETLCAITRNVPSPLATKLSSPGFVGRIFGHALEDSHSKSALVNSLS...

XP_057782630.1
MFWKLTAMSASSPVEAVLDKENFTLEELLDEEEIIQECKALNSRLINFLRDRAQVEQLLHYIVEEPPEDADSKRTFKFPFIACEIFTCEIDVILKTLVDEEELMNLLFSFLEPDRYHSALLAGYFSKVVVCLMLRKTVPLMNYVKAHQDVFRQLVDLIGITSIMEVLVRLVGGDDHLYPNSLDVMQWLADSNLLEMIVDKLNDSNPPEVHANAAETLCAITRNVPSPLATKLSSPGFVGRIFGHALEDSHSKSALVNSLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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