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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001056`

染色体: Chr08 坐标: 8105688-8109030 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001056`
名称	SmilChr08G001056
描述	double-stranded RNA-binding protein 6-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	8105688 - 8109030 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000642`
GeneID	`131000642`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000642`
原始查询	`SmilChr08G001056`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	double-stranded RNA-binding protein 6-like
产物	double-stranded RNA-binding protein 6-like
Arabidopsis	`AT2G28380` (DRB2) dsRNA-binding protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817386] identity=58.4; qcov=1.07; evalue=1.63e-133; confidence=high
Rice	`Os10g0480500` (OsDRB2) - identity=64.4; qcov=0.93; evalue=1.17e-129; confidence=high
GO	GO:0003725 (double-stranded RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00035 (dsrm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000642

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782638.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057782638.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057782638.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057782638.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057782638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:8105963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr8:8105964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:8106409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:8108565`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B7
`Chr8:8108565`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B7
`Chr8:8108613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782638.1

369 aa

184

369

dsrm

PF00035 dsrm 2-68 aa PF00035 dsrm 88-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782638.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	2	68	4.4e-31	108.0	Double-stranded RNA binding motif
`XP_057782638.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	88	153	4.4e-31	108.0	Double-stranded RNA binding motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926655.1
ATAATACTAGTATATTTGAAGGTACGAATAATAATGAATAAATAGGAAAAATTGGGTGTAGAAAATAGATACAGTATATAAGAAAAGGAGATAATAGAAAAGAAGAAAGGGGAAATGTGGAGTGTCATAACCAACGAACCATTCTGCAAATATGATCTCAGCTGCATTTCTCTCTGAAAAAACCACCCATCTCCCCTCCTAATTCCATCAAATCCAATTCTCTATTCTTCGAGAGATGTATAAGAACCAGCTCCAGGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000642
ATGTATAAGAACCAGCTCCAGGAGCTAGCGCAGAGGAGCTGCTTCAATCTGCCCTCCTACACCTGCATCAGAGAGGGTCCCGACCACGCGCCGCGCTTCAAGGCTATCGTCAACTTCAACGGCGACAACTTCGAGAGCCCCAACTACTGCTCCACCCTCCGCCAGGCCGAGCACTCCGCTGCCGAGGCCGCCCTCGCCTCCCTCTCCTCCCGCGGCCCCTCCCATTCCCTCGCCGCCCGCATCCTCGATGAGACGGGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782638.1
MYKNQLQELAQRSCFNLPSYTCIREGPDHAPRFKAIVNFNGDNFESPNYCSTLRQAEHSAAEAALASLSSRGPSHSLAARILDETGVYKNLLQEIAQRVGSPLPQYTTFRSGLGHLPVFTGTVELAGIIFTGEPAKSKKQAEKNAALAAWLSLKLLAQQEASSPSEHECSDEQEQIRIARALQNYRLKEKLMMPNLHNASIPFQKKFLAPTPRPSRPQRPTVPTSKILPFFCQRSASQTRPPSPVNSSHSTTLPQLQPSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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